Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.145488 D4Ertd100eDNA segment, Chr 4, ERATO Doi 100, expressed 4  4 61.0 cM  52213 
 Mm.145488 Yarstyrosyl-tRNA synthetase 4    107271 
 Gene Ontology apoptosis | ATP binding | cell motility | cytoplasm | extracellular space | interleukin-8 receptor binding | ligase activity | nucleic acid binding | protein biosynthesis | RNA binding | signal transducer activity | soluble fraction | tRNA aminoacylation for protein translation | tRNA binding | tRNA ligase activity | tyrosine-tRNA ligase activity | tyrosyl-tRNA aminoacylation
 Human Homolog YARS[tyrosyl-tRNA synthetase]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 130 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACAAAGCTGT (3)
CAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GAAACCTGGG
GGGGTTTTCC (4)
TGGTTTCTGG (2)
65.10.0651
Cb medulloblastomaACAAAGCTGT (3)
ATTTGAAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
GGGGTTTTCC (4)
50.80.0508
P8 GC+1d cultureACAAAGCTGT (3)
CAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
GTCCTCTTTC
TGGTTTCTGG (2)
60.50.0605
P8 GC+SHH+1d cultureACAAAGCTGT (3)
ATTTGAAAAA (2)
CAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
GTCCTCTTTC
TGGTTTCTGG (2)
57.40.0574
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (3)
GGGTTTTCCC (3)
TGGTTTCTGG (2)
77.10.0771
E15 cortexCCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
79.10.0791
P1 cortexACAAAGCTGT (3)
CAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GTCCTCTTTC
TGGTTTCTGG (2)
204.40.2044
HypothalamusACAAAGCTGT (3)
ATTTGAAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
TGGTTTCTGG (2)
36.10.0361
E12.5 retinaCAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GAAACCTGGG
GAAACTTGGG (3)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
GTCCTCTTTC
TGGTTTCTGG (2)
105.20.1052
E14.5 retinaACAAAGCTGT (3)
ATTTGAAAAA (2)
CAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GAAACTTGGG (3)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
TGGTTTCTGG (2)
167.70.1677
E16.5 retinaCAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GTCCTCTTTC
TGGTTTCTGG (2)
103.10.1031
E18.5 retinaCAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
TGGTTTCTGG (2)
56.40.0564
P0.5 retinaCAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGTTTTCCC (3)
TGGTTTCTGG (2)
96.20.0962
P2.5 retinaCAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GAAACTTGGG (3)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
GTCCTCTTTC
TGGTTTCTGG (2)
112.80.1128
P4.5 retinaCAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
GTCCTCTTTC
TGGTTTCTGG (2)
59.60.0596
P6.5 retinaATTTGAAAAA (2)
CAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GTCCTCTTTC
81.70.0817
P10.5 crx- retinaACAAAGCTGT (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
GTCCTCTTTC
TGGTTTCTGG (2)
80.10.0801
P10.5 crx+ retinaATTTGAAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
TGGTTTCTGG (2)
53.70.0537
Adult retinalACAAAGCTGT (3)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GAAACCTGGG
GAAACTTGGG (3)
GGGGTTTTCC (4)
GGGTTTTCCC (3)
150.10.1501
ONLACAAAGCTGT (3)
CAAATTAAAA (2)
CCTTTAATCC (3)
CCTTTAGTCC (2)
GGGGTTTTCC (4)
TGGTTTCTGG (2)
109.20.1092