Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.147091 C230011H18RikRIKEN cDNA C230011H18 gene 2    399590 
 Mm.147091 D230046B21RikRIKEN cDNA D230046B21 gene 2    320325 
 Mm.147091 6430543K15RikRIKEN cDNA 6430543K15 gene 2    320349 
 Mm.147091 B230345P09RikRIKEN cDNA B230345P09 gene 2    319536 
 Mm.147091 Cugbp2CUG triplet repeat,RNA binding protein 2 2    14007 
 Gene Ontology mRNA splice site selection | nucleus | pre-mRNA splicing factor activity
 Human Homolog CUGBP2[CUG triplet repeat, RNA binding protein 2]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 191 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAACCCTTAT (5)
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
ATTGGTGTTA (5)
CAAGACTGAA (5)
CCTACAGTCC (5)
CGTCTGAGAA (6)
GAATTTTATT (4)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
166.40.1664
Cb medulloblastomaACATTTAAAA (3)
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
140.90.1409
P8 GC+1d cultureAAACCCTTAT (5)
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
CCTACAGTCC (5)
GAATTTTATT (4)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
114.10.1141
P8 GC+SHH+1d cultureAAACCCTTAT (5)
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CCTACAGTCC (5)
GAATTTTATT (4)
GAGGGTGTGT (5)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
155.70.1557
3T3 fibroblastsTGGTTGCTGG
220.80.2208
E15 cortexAACTTTTTTT
ACATTTAAAA (3)
CCTACAGTCC (5)
GAATTTTATT (4)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
336.30.3363
P1 cortexAAACCCTTAT (5)
AACTTTTTTT
ATTGGTGTTA (5)
CGTCTGAGAA (6)
GATTGTCTAA (5)
TGGTTGCTGG
TTTCATTGTT (6)
1180.118
HypothalamusAACTTTTTTT
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
CCTACAGTCC (5)
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GATTGTCTAA (5)
GTATGCCCTC (2)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
3820.382
E12.5 retinaAAACCCTTAT (5)
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
2010.201
E14.5 retinaACATTTAAAA (3)
CCTACAGTCC (5)
GAATTTTATT (4)
GATTGTCTAA (5)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
980.20.9802
E16.5 retinaAAACCCTTAT (5)
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
ATTGGTGTTA (5)
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GTATGCCCTC (2)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
811.20.8112
E18.5 retinaACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CCTACAGTCC (5)
CGTCTGAGAA (6)
GAATTTTATT (4)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
309.10.3091
P0.5 retinaAAACCCTTAT (5)
CAAGACTGAA (5)
CCTACAGTCC (5)
GAATTTTATT (4)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
2180.218
P2.5 retinaAAACCCTTAT (5)
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
ATTGGTGTTA (5)
CAAGACTGAA (5)
CATACACTGT
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
216.50.2165
P4.5 retinaACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
ATTGGTGTTA (5)
CAAGACTGAA (5)
CGTCTGAGAA (6)
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GATTGTCTAA (5)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
200.40.2004
P6.5 retinaAAACCCTTAT (5)
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CATACACTGT
CCTACAGTCC (5)
CGTCTGAGAA (6)
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GTATTTTATT (6)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
201.70.2017
P10.5 crx- retinaACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GAGGGTGTGT (5)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
306.70.3067
P10.5 crx+ retinaACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CAAGACTGAA (5)
CTTTTCCCTC
GAATTTTATT (4)
GATTGTCTAA (5)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
130.60.1306
Adult retinalACATTTATTG (5)
CCTACAGTCC (5)
CTTTTCCCTC
GATTGTCTAA (5)
GTATGCCCTC (2)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
TTTCATTGTT (6)
233.60.2336
ONLAAACCCTTAT (5)
ACATTTAAAA (3)
ACATTTATTG (5)
CGTCTGAGAA (6)
GAATTTTATT (4)
GAGGGTGTGT (5)
GTATGCCCTC (2)
TGAGAGAAAA (5)
TGGTTGCTGG
TTGGTGCTTC (7)
421.20.4212