Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.148973 D530015H24RikRIKEN cDNA D530015H24 gene 13    78715 
 Mm.148973 7530408C15RikRIKEN cDNA 7530408C15 gene 13    320987 
 Mm.148973 Hnrpa0heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 13    77134 
 Gene Ontology ribonucleoprotein complex | viral nucleocapsid
 Human Homolog HNRPA0[heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 120 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAATAGAATT (3)50.60.0506
P8 Cb GCCCTGGAATTT (4)37.50.0375
P8 Cb GCTCAAGATGAT (3)17.90.0179
P8 Cb GCGGATCCAAGT (4)13.10.0131
P8 Cb GCGCCGCGTCGC (3)4.90.0049
P8 Cb GCGTGTCACACG (3)1.60.0016
P8 Cb GCTGTTCTCATT (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaCAATAGAATT (3)20.80.0208
Cb medulloblastomaCCTGGAATTT (4)6.90.0069
Cb medulloblastomaTCTAACATTT (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCTGGAATTT (4)30.80.0308
P8 GC+1d cultureCAATAGAATT (3)29.70.0297
P8 GC+1d cultureTCAAGATGAT (3)6.80.0068
P8 GC+1d cultureGGATCCAAGT (4)4.60.0046
P8 GC+1d cultureTCTAACATTT (3)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGCCGCGTCGC (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGTTCTCATT (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTTCAAATCTC (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGTGTCACACG (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTAAACTGCTA (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTACTGTGTAG (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCCTGGAATTT (4)38.60.0386
P8 GC+SHH+1d cultureCAATAGAATT (3)25.80.0258
P8 GC+SHH+1d cultureTCAAGATGAT (3)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureGCCGCGTCGC (3)5.90.0059
P8 GC+SHH+1d cultureGGATCCAAGT (4)5.90.0059
P8 GC+SHH+1d cultureTCTAACATTT (3)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTACGGTCAAA (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTACTGTGTAG (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGTTCTCATT (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTCAAATCTC (4)1.20.0012
3T3 fibroblastsGCCGCGTCGC (3)31.50.0315
3T3 fibroblastsCCTGGAATTT (4)3.50.0035
3T3 fibroblastsGGATCCAAGT (4)3.50.0035
E15 cortexCCTGGAATTT (4)54.40.0544
E15 cortexCAATAGAATT (3)39.60.0396
E15 cortexTCAAGATGAT (3)4.90.0049
P1 cortexCAATAGAATT (3)18.20.0182
P1 cortexTCAAGATGAT (3)13.60.0136
P1 cortexCCTGGAATTT (4)9.10.0091
HypothalamusCAATAGAATT (3)3.60.0036
HypothalamusCCTGGAATTT (4)3.60.0036
HypothalamusTCTAACATTT (3)1.80.0018
HypothalamusTGTTCTCATT (3)1.80.0018
E12.5 retinaCAATAGAATT (3)28.20.0282
E12.5 retinaCCTGGAATTT (4)24.40.0244
E12.5 retinaGGATCCAAGT (4)20.70.0207
E12.5 retinaTCAAGATGAT (3)20.70.0207
E12.5 retinaTGTTCTCATT (3)5.60.0056
E12.5 retinaGCCGCGTCGC (3)3.80.0038
E12.5 retinaTACGGTCAAA (3)1.90.0019
E12.5 retinaTACTGTGTAG (4)1.90.0019
E12.5 retinaTCTAACATTT (3)1.90.0019
E14.5 retinaCCTGGAATTT (4)40.10.0401
E14.5 retinaCAATAGAATT (3)310.031
E14.5 retinaGGATCCAAGT (4)16.40.0164
E14.5 retinaTCAAGATGAT (3)5.50.0055
E16.5 retinaCAATAGAATT (3)32.60.0326
E16.5 retinaCCTGGAATTT (4)25.40.0254
E16.5 retinaGGATCCAAGT (4)12.70.0127
E16.5 retinaTCAAGATGAT (3)7.20.0072
E16.5 retinaTGTTCTCATT (3)5.40.0054
E18.5 retinaCCTGGAATTT (4)43.70.0437
E18.5 retinaCAATAGAATT (3)25.50.0255
E18.5 retinaGGATCCAAGT (4)12.70.0127
E18.5 retinaTCAAGATGAT (3)5.50.0055
E18.5 retinaGCCGCGTCGC (3)3.60.0036
E18.5 retinaTACTGTGTAG (4)3.60.0036
E18.5 retinaGTGTCACACG (3)1.80.0018
E18.5 retinaTAAACTGCTA (3)1.80.0018
E18.5 retinaTACGGTCAAA (3)1.80.0018
P0.5 retinaCCTGGAATTT (4)27.50.0275
P0.5 retinaCAATAGAATT (3)21.60.0216
P0.5 retinaGCCGCGTCGC (3)9.80.0098
P0.5 retinaTCTAACATTT (3)3.90.0039
P0.5 retinaGGATCCAAGT (4)20.002
P0.5 retinaGTGTCACACG (3)20.002
P0.5 retinaTACTGTGTAG (4)20.002
P0.5 retinaTGTTCTCATT (3)20.002
P2.5 retinaCCTGGAATTT (4)45.80.0458
P2.5 retinaCAATAGAATT (3)370.037
P2.5 retinaGGATCCAAGT (4)19.40.0194
P2.5 retinaTCAAGATGAT (3)8.80.0088
P2.5 retinaTGTTCTCATT (3)8.80.0088
P2.5 retinaTTCAAATCTC (4)5.30.0053
P2.5 retinaTACTGTGTAG (4)3.50.0035
P2.5 retinaGCCGCGTCGC (3)1.80.0018
P4.5 retinaCCTGGAATTT (4)43.60.0436
P4.5 retinaCAATAGAATT (3)25.80.0258
P4.5 retinaGGATCCAAGT (4)7.90.0079
P4.5 retinaTCTAACATTT (3)5.90.0059
P4.5 retinaTGTTCTCATT (3)40.004
P4.5 retinaTTCAAATCTC (4)20.002
P6.5 retinaCCTGGAATTT (4)200.02
P6.5 retinaCAATAGAATT (3)150.015
P6.5 retinaGGATCCAAGT (4)50.005
P6.5 retinaTCAAGATGAT (3)50.005
P6.5 retinaGCCGCGTCGC (3)1.70.0017
P6.5 retinaGTGTCACACG (3)1.70.0017
P6.5 retinaTACTGTGTAG (4)1.70.0017
P6.5 retinaTCTAACATTT (3)1.70.0017
P6.5 retinaTTCAAATCTC (4)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCAATAGAATT (3)14.90.0149
P10.5 crx- retinaCCTGGAATTT (4)130.013
P10.5 crx- retinaGGATCCAAGT (4)5.60.0056
P10.5 crx- retinaTAAACTGCTA (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTCAAGATGAT (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCTGGAATTT (4)13.50.0135
P10.5 crx+ retinaTCAAGATGAT (3)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaCAATAGAATT (3)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaGGATCCAAGT (4)3.80.0038
Adult retinalCAATAGAATT (3)7.40.0074
Adult retinalCCTGGAATTT (4)7.40.0074
ONLCCTGGAATTT (4)9.60.0096
ONLCAATAGAATT (3)5.70.0057
ONLGGATCCAAGT (4)3.80.0038
ONLGCCGCGTCGC (3)1.90.0019
ONLTAAACTGCTA (3)1.90.0019
ONLTACTGTGTAG (4)1.90.0019
ONLTCAAGATGAT (3)1.90.0019