Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.149309	B430202H16Rik	RIKEN cDNA B430202H16 gene	8		319324
Mm.149309	Rent1	regulator of nonsense transcripts 1	8	8 33.5 cM	19704
Gene Ontology	ATP binding | DNA restriction | helicase activity | hydrolase activity | type III site-specific deoxyribonuclease activity
Human Homolog	RENT1[regulator of nonsense transcripts 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 61 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACAAACAAA (3) AACAAACAGA (2) CAGGGTGATG (4) 9.7 0.0097 Cb medulloblastoma AACAAACAAA (3) AGCCAGCCCT (2) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 16.1 0.0161 P8 GC+1d culture AACAAACAAA (3) AGCCAGCCCT (2) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 23.9 0.0239 P8 GC+SHH+1d culture AACAAACAAA (3) AACAAACAGT (2) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 24.7 0.0247 3T3 fibroblasts AGCCAGCCCT (2) 7 0.007 P1 cortex AACAAACAAA (3) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 13.5 0.0135 Hypothalamus AACAAACAAA (3) AGCCAGCCCT (2) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 27.1 0.0271 E12.5 retina AACAAACAAA (3) AACAAACAGT (2) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 15.1 0.0151 E14.5 retina CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 9.1 0.0091 E16.5 retina AACAAACAAA (3) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 12.6 0.0126 E18.5 retina AACAAACAAA (3) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 9 0.009 P0.5 retina AACAAACAAA (3) AGCCAGCCCT (2) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 17.7 0.0177 P2.5 retina AACAAACAAA (3) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 33.5 0.0335 P4.5 retina AACAAACAAA (3) AACAAACAGA (2) AACAAACAGT (2) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 23.8 0.0238 P6.5 retina AACAAACAAA (3) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 18.4 0.0184 P10.5 crx- retina AACAAACAAA (3) AACAAACAGT (2) TTTTATTGGT (2) 13 0.013 P10.5 crx+ retina AACAAACAAA (3) AACAAACAGA (2) TTTTATTGGT (2) 7.6 0.0076 Adult retinal AGCCAGCCCT (2) CAGGGTGATG (4) TTTTATTGGT (2) 18.6 0.0186 ONL AACAAACAAA (3) CAGGGTGATG (4) 7.6 0.0076