Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.153895	A930012N16Rik	RIKEN cDNA A930012N16 gene	2		77813
Mm.153895	C79248	expressed sequence C79248	2		96982
Mm.153895	Rnpc2	RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 2	2		170791
Mm.153895	B330012G18Rik	RIKEN cDNA B330012G18 gene	2		320419
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 295 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGAAAAAAAA (2) AGAGAAAAAG (4) AGCCAAATAC ATGTTCTTCT (2) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GTTCAGCAAA (4) TACATATGTG (3) TGCTACCTAG (5) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 211.9 0.2119 Cb medulloblastoma AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GAGGAGTCAT (4) GCAGATGGTT (4) GTAAGCAAAG TATAAATAAA (7) TGCTACCTAG (5) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 261.1 0.2611 P8 GC+1d culture AAATATATAT (3) AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GAGGAGTCAT (4) GCAGATGGTT (4) GTTCAGCAAA (4) TACATATGTG (3) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 182.4 0.1824 P8 GC+SHH+1d culture AAATATATAT (3) AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) ATCCCTGCAT CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GTAAGCAAAG GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) GTTTTATGGC (5) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 220.2 0.2202 3T3 fibroblasts AGAAAAAAAA (2) ATCCCTGCAT CCGGGTGGTG (4) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GCAGATGGTT (4) GCTCCGCGCC GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) TGCTACCTAG (5) TGGTTGCTGG TTTGCTTTAA (3) 346.9 0.3469 E15 cortex AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC CCGGGTGGTG (4) CCTTTAATCC (3) GCCTTCAATA (4) GTTCAGCAAA (4) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTTTTTTTT (2) 380.7 0.3807 P1 cortex AAATATATAT (3) AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC CCTTTAATCC (3) GCAGATGGTT (4) GCTTCAATAT (5) GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) TGCTACCTAG (5) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 349.8 0.3498 Hypothalamus AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC ATGTTCTTCT (2) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) GTTTTATGGC (5) TACATATGTG (3) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTAACTGAAG (7) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 468.9 0.4689 E12.5 retina AAATATATAT (3) AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGAGAAAAAG (4) AGCCAAATAC ATGAATAAAT CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GCCTTCAATA (4) GCTCCGCGCC GTTCAGCAAA (4) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 355.1 0.3551 E14.5 retina AAATATATAT (3) AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGAGAAAAAG (4) AGCCAAATAC CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCTTCAATAT (5) GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) TACATATGTG (3) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 1184 1.184 E16.5 retina AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGAGAAAAAG (4) AGCCAAATAC ATGGATAGTG (4) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GAGGAGTCAT (4) GCAGATGGTT (4) GCTTCAATAT (5) TGCTACCTAG (5) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTAACTGAAG (7) TTTGCTTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 939.8 0.9398 E18.5 retina AAATATATAT (3) AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC ATGTTCTTCT (2) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GTTCAGCAAA (4) TACATATGTG (3) TATAAATAAA (7) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 403.6 0.4036 P0.5 retina AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC ATCCCTGCAT CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GTAAGCAAAG GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TGTTTAGGTA (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 382.9 0.3829 P2.5 retina AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC CCGGGTGGTG (4) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GCTTCAATAT (5) GTTCAGCAAA (4) TATAAATAAA (7) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TGTTTAGGTA (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 357.4 0.3574 P4.5 retina AAATATATAT (3) AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) CCTTTAATCC (3) GTAAGCAAAG GTTCAGCAAA (4) TACATATGTG (3) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 354.8 0.3548 P6.5 retina AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GTTCAGCAAA (4) TACATATGTG (3) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 345.1 0.3451 P10.5 crx- retina AAATATATAT (3) AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC ATCCCTGCAT ATGGATAGTG (4) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GAGGAGTCAT (4) GCAGATGGTT (4) GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) GTTTTATGGC (5) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) 453.4 0.4534 P10.5 crx+ retina AAATATATAT (3) AAGAACGTAG (4) AGAAAAAAAA (2) AGAGAAAAAG (4) CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) TATAAATAAA (7) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTATTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 230.3 0.2303 Adult retinal AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC CCTTCAATCC (2) CCTTTAATCC (3) GCCTTCAATA (4) GTTCAGCAAA (4) GTTTCAGCAA (2) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTTGCTTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 398.3 0.3983 ONL AGAAAAAAAA (2) AGCCAAATAC CCTTTAATCC (3) GACTACAGTA GCAGATGGTT (4) GTTCAGCAAA (4) TGGTTGCTGG TGTGAATGAT (4) TTAACTGAAG (7) TTTGCTTTAA (3) TTTTTTTTTT (2) 549.7 0.5497