Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.159684 Tmpothymopoietin 10  10 C2 (10 49.0 cM)  21917 
 Mm.159684 5830485P09RikRIKEN cDNA 5830485P09 gene 10    76121 
 Mm.159684 AW547477expressed sequence AW547477 10    103472 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 162 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGTAAATTT
ATTCCGAATT (2)
CCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GAAGTCCTAC (3)
GACCCCCCCC
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TATGGCTTAG (3)
TGGATAAAAA (4)
TTTTGCCTTA (3)
115.80.1158
Cb medulloblastomaCCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GACCCCCCCC
GGTTTTGTGT (4)
TACCTGTGAA (4)
TGGATAAAAA (4)
62.30.0623
P8 GC+1d cultureAGGTAAATTT
CCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GACCCCCCCC
GCACAGGCAG (2)
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
GTGGGAACAA (2)
TACCTGTGAA (4)
TATGGCTTAG (3)
TGGGATAAAA
69.60.0696
P8 GC+SHH+1d cultureAGGTAAATTT
CCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
CTTGAAATTT
GAAGTCCTAC (3)
GACCCCCCCC
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TATGGCTTAG (3)
TGGATAAAAA (4)
TGGCTCATCT (4)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
84.40.0844
3T3 fibroblastsCCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GACACCGAGA (3)
GTGGGAACAA (2)
80.60.0806
E15 cortexCCTTTAATCC (3)
GACCCCCCCC
GTGATGTAAT (3)
98.90.0989
P1 cortexCCTTTAATCC (3)
GACCCCCCCC
GGTTTTGTGT (4)
GTGGGAACAA (2)
172.60.1726
HypothalamusAGGTAAATTT
CCCTTTTTTT (4)
CCTTTAATCC (3)
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
TGGCTCATCT (4)
TTTTGTGTAT
30.70.0307
E12.5 retinaCCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GAAGTCCTAC (3)
GTGATGTAAT (3)
GTGGGAACAA (2)
TACCTGTGAA (4)
TAGAAAATAA (3)
TATGGCTTAG (3)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
133.60.1336
E14.5 retinaCCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
TACAAAATAA (2)
TACCTGTGAA (4)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
156.60.1566
E16.5 retinaCCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GACACCGAGA (3)
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
GTGGGAACAA (2)
TACCTGTGAA (4)
TAGAAAATAA (3)
TTCTGGTCTC (3)
TTTTGCCTTA (3)
108.50.1085
E18.5 retinaCCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GACCCCCCCC
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TAGAAAATAA (3)
TATGGCTTAG (3)
TGGATAAAAA (4)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
76.20.0762
P0.5 retinaCCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
CTTGAAATTT
GTGATGTAAT (3)
GTGGGAACAA (2)
TACCTGTGAA (4)
TTCTGGTCTC (3)
TTTTACCTGG (3)
TTTTGCCTTA (3)
137.50.1375
P2.5 retinaAGGTAAATTT
CCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GAAGTCCTAC (3)
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
TACAAAATAA (2)
TACCTGTGAA (4)
TTTTACCTGG (3)
119.90.1199
P4.5 retinaATTCCGAATT (2)
CCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GTGATGTAAT (3)
TACAAAATAA (2)
TACCTGTGAA (4)
TATGGCTTAG (3)
TGGCTCATCT (4)
TGGGATAAAA
77.40.0774
P6.5 retinaATTCCGAATT (2)
CCATTTTTTA (5)
CCCTTTTTTT (4)
CCTTTAATCC (3)
GCACAGGCAG (2)
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
TACCTGTGAA (4)
TGGGATAAAA
91.80.0918
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (3)
GACCCCCCCC
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
GTGGGAACAA (2)
TATGGTTAGA (3)
81.90.0819
P10.5 crx+ retinaCCTTTAATCC (3)
CTTGAAATTT
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
GTGGGAACAA (2)
TACCTGTGAA (4)
TATGGTTAGA (3)
55.60.0556
Adult retinalCCATTTTTTA (5)
CCTTTAATCC (3)
GACCCCCCCC
GCACAGGCAG (2)
GGTTTTGTGT (4)
TACCTGTGAA (4)
TTTTGTGTAT
142.80.1428
ONLAGGTAAATTT
ATTCCGAATT (2)
CCTTTAATCC (3)
GGTTTTGTGT (4)
GTGATGTAAT (3)
TATGGTTAGA (3)
TTTTGTGTAT
124.40.1244