Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.159915 Wdr42aWD repeat domain 42A 1  1 93.7 cM  98193 
 Mm.159915 AA433120expressed sequence AA433120 1    98204 
 Mm.159915 8430437O03RikRIKEN cDNA 8430437O03 gene 1    71536 
 Mm.159915 B230205O20RikRIKEN cDNA B230205O20 gene 1    77413 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (658)203.90.2039
P8 Cb GCCACTCTGGAA (5)1.60.0016
P8 Cb GCTTCAGCTCGG (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (658)797.80.7978
Cb medulloblastomaCACTCTGGAA (5)9.20.0092
Cb medulloblastomaCCACTCTCTT (4)4.60.0046
Cb medulloblastomaAAACAAAAAA (12)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (658)204.30.2043
P8 GC+1d cultureCCTGCTGCTC (14)4.60.0046
P8 GC+1d cultureCACTCTGGAA (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureATTTGTTGGG (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCCGCTCTCTT (6)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGTGTAGGGCT (8)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (658)278.70.2787
P8 GC+SHH+1d cultureCCTGCTGCTC (14)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureCACTCTGGAA (5)2.30.0023
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (658)280.028
3T3 fibroblastsCCGCTCTCTT (6)140.014
3T3 fibroblastsGAACACCCCA (9)3.50.0035
E15 cortexAAAAAAAAAA (658)212.80.2128
E15 cortexATTTGTTGGG (5)4.90.0049
E15 cortexCACTCTGGAA (5)4.90.0049
E15 cortexCCACTCTCTT (4)4.90.0049
P1 cortexAAAAAAAAAA (658)245.40.2454
P1 cortexGGCAAGCAAA (7)4.50.0045
HypothalamusAAAAAAAAAA (658)123.20.1232
HypothalamusCACTCTGGAA (5)5.40.0054
HypothalamusAAACAAAAAA (12)1.80.0018
HypothalamusCCACTCTCTT (4)1.80.0018
HypothalamusCCCAGCCTTC (7)1.80.0018
HypothalamusGAACACCCCA (9)1.80.0018
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (658)138.90.1389
E12.5 retinaCACTCTGGAA (5)11.30.0113
E12.5 retinaCCACTCTCTT (4)11.30.0113
E12.5 retinaATTTGTTGGG (5)9.40.0094
E12.5 retinaCCTGCTGCTC (14)5.60.0056
E12.5 retinaTTCAGCTCGG (4)1.90.0019
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (658)94.70.0947
E14.5 retinaCACTCTGGAA (5)5.50.0055
E14.5 retinaGAACACCCCA (9)3.60.0036
E14.5 retinaAAACAAAAAA (12)1.80.0018
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (658)43.50.0435
E16.5 retinaCACTCTGGAA (5)7.20.0072
E16.5 retinaCCTGCTGCTC (14)5.40.0054
E16.5 retinaACTGAAGTGT (5)1.80.0018
E16.5 retinaATTTGTTGGG (5)1.80.0018
E16.5 retinaGTGTAGGGCT (8)1.80.0018
E16.5 retinaTACAAAAGAT (6)1.80.0018
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (658)374.70.3747
E18.5 retinaCACTCTGGAA (5)5.50.0055
E18.5 retinaAAACAAAAAA (12)3.60.0036
E18.5 retinaTACAAAAGAT (6)3.60.0036
E18.5 retinaATTTGTTGGG (5)1.80.0018
E18.5 retinaCCTGCTGCTC (14)1.80.0018
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (658)117.80.1178
P0.5 retinaAATCATCTGA (7)3.90.0039
P0.5 retinaATTTGTTGGG (5)20.002
P0.5 retinaCACTCTGGAA (5)20.002
P0.5 retinaCCACTCTCTT (4)20.002
P0.5 retinaCCCAGCCTTC (7)20.002
P0.5 retinaTACAAAAGAT (6)20.002
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (658)329.10.3291
P2.5 retinaCACTCTGGAA (5)70.007
P2.5 retinaCCACTCTCTT (4)5.30.0053
P2.5 retinaAAACAAAAAA (12)1.80.0018
P2.5 retinaAATCATCTGA (7)1.80.0018
P2.5 retinaATTTGTTGGG (5)1.80.0018
P2.5 retinaGAACACCCCA (9)1.80.0018
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (658)283.30.2833
P4.5 retinaCACTCTGGAA (5)11.90.0119
P4.5 retinaCCTGCTGCTC (14)40.004
P4.5 retinaAAACAAAAAA (12)20.002
P4.5 retinaATTTGTTGGG (5)20.002
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (658)266.80.2668
P6.5 retinaCACTCTGGAA (5)3.30.0033
P6.5 retinaCCTGCTGCTC (14)1.70.0017
P6.5 retinaGAACACCCCA (9)1.70.0017
P6.5 retinaGGCAAGCAAA (7)1.70.0017
P6.5 retinaTACAAAAGAT (6)1.70.0017
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (658)44.60.0446
P10.5 crx- retinaCACTCTGGAA (5)7.40.0074
P10.5 crx- retinaACTGAAGTGT (5)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCCTGCTGCTC (14)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (658)96.10.0961
P10.5 crx+ retinaCACTCTGGAA (5)11.50.0115
P10.5 crx+ retinaCCGCTCTCTT (6)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaCCTGCTGCTC (14)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaACTGAAGTGT (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaATTTGTTGGG (5)1.90.0019
Adult retinalAAAAAAAAAA (658)57.40.0574
Adult retinalCACTCTGGAA (5)3.70.0037
Adult retinalCCTGCTGCTC (14)3.70.0037
Adult retinalATTTGTTGGG (5)1.90.0019
Adult retinalGAACACCCCA (9)1.90.0019
Adult retinalGGCAAGCAAA (7)1.90.0019
ONLAAAAAAAAAA (658)103.40.1034
ONLCACTCTGGAA (5)3.80.0038
ONLCCCAGCCTTC (7)3.80.0038
ONLTACAAAAGAT (6)1.90.0019