Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.166372	Rnf130	ring finger protein 130	11		59044
Gene Ontology	extracellular space | integral to membrane | peptidase activity | proteolysis and peptidolysis
Human Homolog	RNF130[ring finger protein 130]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 73 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) CCACACAAGC (3) TCTAATCTGT 53.8 0.0538 Cb medulloblastoma AACCTCTATG (3) AAGACTTGAG CAAAAAAAAA (2) CCACACAAGC (3) 120.2 0.1202 P8 GC+1d culture AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) CACAACAAAG (2) CCACACAAGC (3) 53.6 0.0536 P8 GC+SHH+1d culture AACCTCTATG (3) ACACTTTTAT (3) CAAAAAAAAA (2) CACAACAAAG (2) CCACACAAGC (3) 63.3 0.0633 E15 cortex AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) 39.5 0.0395 P1 cortex AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) TCTAATCTGT 31.7 0.0317 Hypothalamus AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) CCACACAAGC (3) 47 0.047 E12.5 retina ACACTTTTAT (3) CAAAAAAAAA (2) CACAACAAAG (2) CCACACAAGC (3) CCACCTTCCT (2) 37.6 0.0376 E14.5 retina ACACTTTTAT (3) CAAAAAAAAA (2) CACAACAAAG (2) CCACACAAGC (3) CCACCTTCCT (2) 25.5 0.0255 E16.5 retina ACACTTTTAT (3) CAAAAAAAAA (2) CCACACAAGC (3) CCACCTTCCT (2) 25.4 0.0254 E18.5 retina CAAAAAAAAA (2) CACAACAAAG (2) CCACACAAGC (3) 49.1 0.0491 P0.5 retina AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) CCACACAAGC (3) CCACCTTCCT (2) 151.2 0.1512 P2.5 retina AACCTCTATG (3) AGATTTTTGT (2) CAAAAAAAAA (2) CCACACAAGC (3) 58.2 0.0582 P4.5 retina AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) CACAACAAAG (2) 51.5 0.0515 P6.5 retina AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) CACAACAAAG (2) CCACACAAGC (3) 41.8 0.0418 P10.5 crx- retina AACCTCTATG (3) CAAAAAAAAA (2) CCACACAAGC (3) 29.7 0.0297 P10.5 crx+ retina AACCTCTATG (3) AGATTTTTGT (2) CAAAAAAAAA (2) CACAACAAAG (2) CCACACAAGC (3) 48 0.048 Adult retinal AAGACTTGAG ACACTTTTAT (3) AGATTTTTGT (2) CAAAAAAAAA (2) CCACACAAGC (3) 29.8 0.0298 ONL AAGACTTGAG AGATTTTTGT (2) CAAAAAAAAA (2) 21 0.021