Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.17436 Trim37tripartite motif protein 37 11    68729 
 Mm.17436 D5Mgi13DNA Segment, Chr 5, Mouse Genome Informatics 13 5    100977 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 108 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGGGCAAAA
CTAGGCAAGC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
TCTGGGGAAA (2)
39.30.0393
Cb medulloblastomaAAGGGCAAAA
CTAGGCAAGC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GAACAGAAAT (2)
GTGACTGTCC
TATTTCAAAA (3)
73.90.0739
P8 GC+1d cultureAAGGGCAAAA
CTTTTTTCAG (3)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
30.80.0308
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGGCAAAA
CTTTTTTCAG (3)
GAACAGAAAT (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
24.50.0245
3T3 fibroblastsGTGATAGCTT (2)
70.007
E15 cortexAAGGGCAAAA
GTGATAGCTT (2)
9.80.0098
P1 cortexAAGGGCAAAA
4.50.0045
HypothalamusAAGGGCAAAA
CTAGGCAAGC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
28.90.0289
E12.5 retinaAGCTGTCACT (2)
CAGACAAACC (2)
CAGGTGGGGG (2)
CTTTTTTCAG (3)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TCTGGGGAAA (2)
32.10.0321
E14.5 retinaAAGGGCAAAA
AGCTGTCACT (2)
CAGACAAACC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GAACAGAAAT (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
36.40.0364
E16.5 retinaAAGGGCAAAA
CAGACAAACC (2)
CAGGTGGGGG (2)
CTAGGCAAGC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GAACAGAAAT (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
23.40.0234
E18.5 retinaCTAGGCAAGC (2)
GAACAGAAAT (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
21.80.0218
P0.5 retinaAAGGGCAAAA
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
13.70.0137
P2.5 retinaAAGGGCAAAA
CAGACAAACC (2)
CAGGTGGGGG (2)
CTAGGCAAGC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GAACAGAAAT (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
28.30.0283
P4.5 retinaCAGACAAACC (2)
CAGGTGGGGG (2)
GAACAGAAAT (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
27.90.0279
P6.5 retinaAAGGGCAAAA
CTAGGCAAGC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GAACAGAAAT (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
28.40.0284
P10.5 crx- retinaAAGGGCAAAA
CTAGGCAAGC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
18.70.0187
P10.5 crx+ retinaCAGACAAACC (2)
CTAGGCAAGC (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
230.023
Adult retinalAAGGGCAAAA
CTAGGCAAGC (2)
CTTTTTTCAG (3)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
150.015
ONLCAGACAAACC (2)
CTAGGCAAGC (2)
GTGACTGTCC
GTGATAGCTT (2)
TATTTCAAAA (3)
11.40.0114