Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.182053 Ubqln1ubiquilin 1 13  13 35.0 cM  56085 
 Gene Ontology nucleus
 Human Homolog UBQLN1[ubiquilin 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 83 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGTGTGCTCT (2)13.10.0131
P8 Cb GCGCTCCTCCAA (8)8.20.0082
P8 Cb GCTTTTCTTCCC (5)3.30.0033
Cb medulloblastomaTGTGTGCTCT (2)16.20.0162
Cb medulloblastomaGCTCCTCCAA (8)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTTTCTTCCC (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGTGTGCTCT (2)17.10.0171
P8 GC+1d cultureCATCAAACAC6.80.0068
P8 GC+1d cultureCAGCAGCCTC (7)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGGATTCTTCG2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGTGCTCT (2)18.70.0187
P8 GC+SHH+1d cultureCATCAAACAC3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureTTTTCTTCCC (5)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureACTAGTGCTT (80)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureACTGAGGAGG (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureAGCACCTCGG (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCTCTCAAAAT (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCTCTGATGTG (4)1.20.0012
3T3 fibroblastsCAGGCGCTGC (4)10.50.0105
3T3 fibroblastsTGTGTGCTCT (2)70.007
E15 cortexCAGCAGCCTC (7)4.90.0049
E15 cortexTGTGTGCTCT (2)4.90.0049
P1 cortexTGTGTGCTCT (2)13.60.0136
P1 cortexCTCTGATGTG (4)4.50.0045
HypothalamusTGTGTGCTCT (2)9.10.0091
HypothalamusCTCTGATGTG (4)3.60.0036
HypothalamusCAGCAGCCTC (7)1.80.0018
HypothalamusCTCTCAAAAT (4)1.80.0018
E12.5 retinaTGTGTGCTCT (2)7.50.0075
E12.5 retinaCATCAAACAC3.80.0038
E12.5 retinaACTAGTGCTT (80)1.90.0019
E12.5 retinaCTCTCAAAAT (4)1.90.0019
E12.5 retinaCTCTGATGTG (4)1.90.0019
E14.5 retinaTGTGTGCTCT (2)7.30.0073
E14.5 retinaCAGCAGCCTC (7)1.80.0018
E14.5 retinaCAGCAGCCTT (2)1.80.0018
E16.5 retinaCTCTGATGTG (4)5.40.0054
E16.5 retinaTTTTCTTCCC (5)3.60.0036
E16.5 retinaACTGAGGAGG (4)1.80.0018
E16.5 retinaAGCACCTCGG (4)1.80.0018
E16.5 retinaCATCAAACAC1.80.0018
E16.5 retinaTGTGTGCTCT (2)1.80.0018
E18.5 retinaTGTGTGCTCT (2)12.70.0127
E18.5 retinaCACTTTTGCA (5)1.80.0018
E18.5 retinaCAGCAGCCTC (7)1.80.0018
P0.5 retinaCTCTGATGTG (4)11.80.0118
P0.5 retinaTGTGTGCTCT (2)7.90.0079
P2.5 retinaTGTGTGCTCT (2)70.007
P2.5 retinaCACTTTTGCA (5)5.30.0053
P2.5 retinaCATCAAACAC3.50.0035
P2.5 retinaCTCTGATGTG (4)3.50.0035
P4.5 retinaTGTGTGCTCT (2)5.90.0059
P4.5 retinaCTCTGATGTG (4)40.004
P4.5 retinaACTAGTGCTT (80)20.002
P4.5 retinaCAGCAGCCTT (2)20.002
P4.5 retinaCTCTCAAATT (3)20.002
P6.5 retinaCTCTGATGTG (4)6.70.0067
P6.5 retinaTGTGTGCTCT (2)50.005
P6.5 retinaCTCTCAAATT (3)3.30.0033
P6.5 retinaCACTTTTGCA (5)1.70.0017
P6.5 retinaCAGCAGCCTC (7)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCTCTCAAATT (3)11.10.0111
P10.5 crx- retinaTGTGTGCTCT (2)5.60.0056
P10.5 crx- retinaCTCTGATGTG (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaAGCACCTCGG (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCAGGCGCTGC (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCTCTCAAAAT (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGTGTGCTCT (2)17.30.0173
P10.5 crx+ retinaCTCTCAAATT (3)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaCTCTGATGTG (4)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaACTGAGGAGG (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCACTTTTGCA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCATCAAACAC1.90.0019
Adult retinalTGTGTGCTCT (2)130.013
Adult retinalCTCTGATGTG (4)11.10.0111
Adult retinalCTCTCAAATT (3)5.60.0056
Adult retinalCAGGCGCTGC (4)3.70.0037
Adult retinalCAGCAGCCTT (2)1.90.0019
ONLCTCTCAAATT (3)17.20.0172
ONLTGTGTGCTCT (2)7.70.0077
ONLCAGCAGCCTC (7)3.80.0038
ONLCTCTGATGTG (4)1.90.0019
ONLGGATTCTTCG1.90.0019