Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.182912	Ghitm	growth hormone inducible transmembrane protein	14	14 15.0 cM	66092
Gene Ontology	integral to membrane
Human Homolog	GHITM[growth hormone inducible transmembrane protein]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 112 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACAAAGCAA (2) CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 22.8 0.0228 Cb medulloblastoma AACAAAGCAA (2) ACTGGGCATT CCTTTTCCTT (2) CCTTTTTTTT (2) CTTTCAATTA TGTGCGCCCT (3) TTGGCTGCAA 46.1 0.0461 P8 GC+1d culture AACAAAGCAA (2) ACTGGGCATT CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CTTCCAATTA (2) CTTTCAATTA TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 31.7 0.0317 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) CTTCCAATTA (2) CTTTCAATTA GGATGGGGAT TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 29.4 0.0294 3T3 fibroblasts CTTTTCTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTGGCTGCAA 14 0.014 E15 cortex AACAATTCAA CCTTTTCCTT (2) TGTGCGCCCT (3) 34.6 0.0346 P1 cortex CCTTTTCCTT (2) TTTAAAATGT (2) 27.2 0.0272 Hypothalamus AACAAAGCAA (2) AGTGACAAGT CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT TGGGCTGCAA TGTGCGCCCT (3) 19.9 0.0199 E12.5 retina CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) CTTTTCTTTT (2) 26.4 0.0264 E14.5 retina CCTTTTCCTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 23.7 0.0237 E16.5 retina AACAAAGCAA (2) ACTGGGCATT ATTAAAGATA CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) CTGAAAAGAA TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 50.6 0.0506 E18.5 retina AACAAAGCAA (2) CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) 21.8 0.0218 P0.5 retina ATTAAAGATA CCTTTTCCTT (2) CCTTTTTTTT (2) TGGGCTGCAA TGTGCGCCCT (3) 21.7 0.0217 P2.5 retina AACAAAGCAA (2) CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CTTTTCTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 33.6 0.0336 P4.5 retina AACAAAGCAA (2) AACAATTCAA CCTTTTCCTT (2) CCTTTTTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 23.9 0.0239 P6.5 retina AACAAAGCAA (2) ACTCCCTGTC CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CTTTCAATTA TGTGCGCCCT (3) 21.7 0.0217 P10.5 crx- retina AACAAAGCAA (2) ACTCCCTGTC AGTGACAAGT CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 61.4 0.0614 P10.5 crx+ retina AACAATTCAA ACTCCCTGTC ACTGGGCATT CCTTTTCCTT (2) TGGGCTGCAA TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 19.1 0.0191 Adult retinal ACTGGGCATT ATTAAAGATA CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT TTTAAAATGT (2) 33.4 0.0334 ONL AACAAAGCAA (2) AACAATTCAA AGTGACAAGT CCTTTTCCTT (2) CTTTCAATTA TTGGCTGCAA 36.3 0.0363