Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.18962 2010010M04RikRIKEN cDNA 2010010M04 gene 18    66546 
 Mm.18962 C77405expressed sequence C77405 18    98108 
 Mm.18962 Catna1catenin alpha 1 18  18 11.0 cM  12385 
 Gene Ontology adherens junction | cell adhesion | cytoskeleton | lamellipodium | protein binding | structural molecule activity | zonula adherens
 Human Homolog CTNNA1[catenin (cadherin-associated protein), alpha 1, 102kDa]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 108 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAAGCAGGAC (3)
CTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GAAGATGAAG (4)
TTCTGGCTGC
TTTGGGCTGC (3)
TTTGTGTCAA
53.80.0538
Cb medulloblastomaCTCCAGGGCA (2)
GATGTGCTGC (2)
GCAGCAAAAA (4)
GGAGCAGAAA
TTCTGGCTGC
TTTGGGCTGC (3)
36.90.0369
P8 GC+1d cultureCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GGAGCAGAAA
GTTGCTGTTT
TTCTGGCTGC
TTTGGGCTGC (3)
TTTGTGTCAA
45.70.0457
P8 GC+SHH+1d cultureCAAGCAGGAC (3)
CTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GTTGCTGTTT
TTCTGGCTGC
TTTGTGTCAA
30.40.0304
3T3 fibroblastsCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GTTGCTGTTT
TTCTGGCTGC
560.056
E15 cortexCTCCAGGGCA (2)
GCAGCAAAAA (4)
TTCTGGCTGC
TTTGGGCTGC (3)
34.50.0345
P1 cortexCTCCAGGGCA (2)
GTTGCTGTTT
TCCCTATTAT (3)
TTCTGGCTGC
54.40.0544
HypothalamusATTAAAATTA (3)
CTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
TGGTCACCTG
TTCTGGCTGC
TTTGTGTTAA (3)
27.10.0271
E12.5 retinaCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
TTCTGGCTGC
TTTGTGTTAA (3)
33.80.0338
E14.5 retinaCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GTTGCTGTTT
TTCTGGCTGC
TTTGTGTCAA
41.80.0418
E16.5 retinaCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GCAGCAAAAA (4)
GGAGCAGAAA
TCCCTATTAT (3)
TTCTGGCTGC
TTTGTGTCAA
52.40.0524
E18.5 retinaCTCCAGGGCA (2)
TTCTGGCTGC
TTTGTGTCAA
400.04
P0.5 retinaCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GATGTGCTGC (2)
GTTGCTGTTT
TCCCTATTAT (3)
TTCTGGCTGC
TTTGTGTTAA (3)
53.20.0532
P2.5 retinaCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GATGTGCTGC (2)
GTTGCTGTTT
TGGTCACCTG
TTCTGGCTGC
TTTGTGTCAA
51.20.0512
P4.5 retinaCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GTTGCTGTTT
TTCTGGCTGC
TTTGGGCTGC (3)
TTTGTGTCAA
59.40.0594
P6.5 retinaATTAAAATTA (3)
CAAGCAGGAC (3)
CTCCAGGGCA (2)
GGAGCAGAAA
GTTGCTGTTT
TCCCTATTAT (3)
TTCTGGCTGC
TTTGGGCTGC (3)
TTTGTGTCAA
48.40.0484
P10.5 crx- retinaCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GTTGCTGTTT
TTCTGGCTGC
TTTGTGTCAA
35.40.0354
P10.5 crx+ retinaCTTCCCTGTT (5)
TGGTCACCTG
TTCTGGCTGC
230.023
Adult retinalCTCCAGGGCA (2)
CTTCCCTGTT (5)
GTTGCTGTTT
TCCCTATTAT (3)
TTCTGGCTGC
39.10.0391
ONLATTAAAATTA (3)
GTTGCTGTTT
TTCTGGCTGC
13.40.0134