Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.196544 Karslysyl-tRNA synthetase 8  8 55.0 cM  85305 
 Gene Ontology ATP binding | intracellular | ligase activity | lysine-tRNA ligase activity | lysyl-tRNA aminoacylation | nucleic acid binding | protein biosynthesis | tRNA aminoacylation for protein translation | tRNA ligase activity
 Human Homolog KARS[lysyl-tRNA synthetase]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 78 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAACTATGGT (2)4.90.0049
P8 Cb GCCTGCCTTAAT (2)3.30.0033
P8 Cb GCAAGAAGGGGT (4)1.60.0016
P8 Cb GCGCCAACTCCA (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaCTGCCTTAAT (2)9.20.0092
Cb medulloblastomaCAACTATGGT (2)4.60.0046
P8 GC+1d cultureCAACTATGGT (2)4.60.0046
P8 GC+1d cultureACTTGTAACT2.30.0023
P8 GC+1d cultureCTGCCTTAAT (2)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCAACTATGGT (2)10.50.0105
P8 GC+SHH+1d cultureCTGCCTTAAT (2)8.20.0082
P8 GC+SHH+1d cultureGGGGGAAAAA (20)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureAAGAAGGGGT (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureAAGCCAGAGG (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureACTTGTAACT1.20.0012
3T3 fibroblastsGTCATAGCTG (590)10.50.0105
3T3 fibroblastsCTGCCTTAAT (2)70.007
E15 cortexGGGGGAAAAA (20)9.90.0099
E15 cortexCCCCACCCCG (2)4.90.0049
E15 cortexCTGCCTTAAT (2)4.90.0049
E15 cortexGTCATAGCTG (590)4.90.0049
P1 cortexCTGCCTTAAT (2)4.50.0045
P1 cortexGGGGGAAAAA (20)4.50.0045
HypothalamusCAACTATGGT (2)5.40.0054
HypothalamusCTGCCTTAAT (2)3.60.0036
HypothalamusAAGAAGGAGA (3)1.80.0018
HypothalamusAAGAAGGGGT (4)1.80.0018
HypothalamusGGGGGAAAAA (20)1.80.0018
E12.5 retinaCTGCCTTAAT (2)35.70.0357
E12.5 retinaCAACTATGGT (2)7.50.0075
E12.5 retinaCCCCACCCCG (2)1.90.0019
E14.5 retinaCTGCCTTAAT (2)23.70.0237
E14.5 retinaCAACTATGGT (2)7.30.0073
E14.5 retinaAAGAAGGAGA (3)1.80.0018
E14.5 retinaAAGAAGGGGT (4)1.80.0018
E14.5 retinaAAGCCAGAGG (2)1.80.0018
E14.5 retinaGCCAACTCCA (2)1.80.0018
E16.5 retinaCAACTATGGT (2)7.20.0072
E16.5 retinaCTGCCTTAAT (2)3.60.0036
E16.5 retinaAAGAAGGGGT (4)1.80.0018
E16.5 retinaCCCCACCCCG (2)1.80.0018
E16.5 retinaTGCCTTCTAG1.80.0018
E18.5 retinaCTGCCTTAAT (2)18.20.0182
E18.5 retinaCAACTATGGT (2)5.50.0055
E18.5 retinaAAGAAGGAGA (3)1.80.0018
E18.5 retinaGCCAACTCCA (2)1.80.0018
E18.5 retinaGGGGGAAAAA (20)1.80.0018
P0.5 retinaCAACTATGGT (2)11.80.0118
P0.5 retinaCTGCCTTAAT (2)3.90.0039
P0.5 retinaGTCATAGCTG (590)3.90.0039
P2.5 retinaCAACTATGGT (2)8.80.0088
P2.5 retinaCTGCCTTAAT (2)5.30.0053
P2.5 retinaAAGAAGGGGT (4)1.80.0018
P2.5 retinaGGGGGAAAAA (20)1.80.0018
P2.5 retinaGTCATAGCTG (590)1.80.0018
P4.5 retinaCTGCCTTAAT (2)5.90.0059
P4.5 retinaCAACTATGGT (2)20.002
P4.5 retinaCCCCACCCCG (2)20.002
P4.5 retinaGTCATAGCTG (590)20.002
P4.5 retinaTGCCTTCTAG20.002
P6.5 retinaCAACTATGGT (2)11.70.0117
P6.5 retinaCTGCCTTAAT (2)3.30.0033
P6.5 retinaGTCATAGCTG (590)3.30.0033
P10.5 crx- retinaCAACTATGGT (2)5.60.0056
P10.5 crx- retinaCTGCCTTAAT (2)3.70.0037
P10.5 crx- retinaAAGAAGGGGT (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCAACTATGGT (2)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaCTGCCTTAAT (2)1.90.0019
Adult retinalATGAACACTG (30)11.10.0111
Adult retinalCTGCCTTAAT (2)5.60.0056
Adult retinalCAACTATGGT (2)1.90.0019
Adult retinalGTCATAGCTG (590)1.90.0019
ONLATGAACACTG (30)13.40.0134
ONLCAACTATGGT (2)7.70.0077
ONLGTCATAGCTG (590)5.70.0057
ONLCTGCCTTAAT (2)3.80.0038
ONLAAGCCAGAGG (2)1.90.0019
ONLTGCCTTCTAG1.90.0019