Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.196721 AW822243expressed sequence AW822243 12    105055 
 Mm.196721 Brf1BRF1 homolog, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB (S. cerevisiae) 12    72308 
 Gene Ontology biological_process unknown | cellular_component unknown | translation initiation factor activity
 Human Homolog BRF1[BRF1 homolog, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB (S. cerevisiae)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 45 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGTCAGAGAGT (2)
GTGGAGCCGC (2)
3.20.0032
Cb medulloblastomaGTGGAGCCGC (2)
2.30.0023
P8 GC+1d cultureAACAAAGGAC (2)
GTGGAGCCGC (2)
TTTTGAGCAA (2)
4.50.0045
P8 GC+SHH+1d cultureGTGGAGCCGC (2)
TTTTGAGCAA (2)
5.90.0059
E15 cortexGCAGCATCCA (2)
4.90.0049
HypothalamusGCAGCATCCA (2)
GTCAGAGAGT (2)
5.40.0054
E12.5 retinaGCAGCATCCA (2)
GTGGAGCCGC (2)
3.80.0038
E14.5 retinaATTCCCAATA (2)
GCAGCATCCA (2)
GTCAGAGAGT (2)
TTTTGAGCAA (2)
19.90.0199
E16.5 retinaGCAGCATCCA (2)
GTCAGAGAGT (2)
TTTTGAGCAA (2)
10.80.0108
E18.5 retinaGCAGCATCCA (2)
GTCAGAGAGT (2)
TTTTGAGCAA (2)
90.009
P0.5 retinaATTCCCAATA (2)
GCAGCATCCA (2)
GTCAGAGAGT (2)
TTTTGAGCAA (2)
15.80.0158
P2.5 retinaTTTTGAGCAA (2)
3.50.0035
P4.5 retinaATTCCCAATA (2)
GCAGCATCCA (2)
GTCAGAGAGT (2)
GTGGAGCCGC (2)
TTTTGAGCAA (2)
19.90.0199
P6.5 retinaGTCAGAGAGT (2)
TTTTGAGCAA (2)
8.30.0083
P10.5 crx- retinaATTCCCAATA (2)
GCAGCATCCA (2)
TTTTGAGCAA (2)
11.20.0112
P10.5 crx+ retinaGCAGCATCCA (2)
TTTTGAGCAA (2)
9.60.0096
Adult retinalGTCAGAGAGT (2)
GTGGAGCCGC (2)
TTTTGAGCAA (2)
7.50.0075
ONLAACAAAGGAC (2)
GCAGCATCCA (2)
5.70.0057