Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.200859 2610005M20RikRIKEN cDNA 2610005M20 gene 9    70308 
 Mm.200859 Pafah1b2platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform 1b, alpha2 subunit 9    18475 
 Gene Ontology 1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase activity | catalytic activity | cytoplasm | hydrolase activity | lipid catabolism | spermatogenesis | spermatogenesis
 Human Homolog PAFAH1B2[platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, beta subunit 30kDa]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAAAAAAAAA (2)
CACTGCCGTC (2)
CTACGGGAGT (2)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GTTTTAAAAA (3)
65.20.0652
Cb medulloblastomaCAAAAAAAAA (2)
CTTGTCACTC (3)
GTTTTAAAAA (3)
101.70.1017
P8 GC+1d cultureCAAAAAAAAA (2)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GGAAACAGGG (2)
GTCAGTTCTT
GTTTTAAAAA (3)
TCTTCATTAG (2)
56.90.0569
P8 GC+SHH+1d cultureCAAAAAAAAA (2)
CACTGCCGTC (2)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GGAAACAGGG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TCTTCATTAG (2)
84.30.0843
3T3 fibroblastsCACTGCCGTC (2)
CTACGGGAGT (2)
CTTGTCACTC (3)
10.50.0105
E15 cortexCAAAAAAAAA (2)
CAGTTGCTGG (3)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GGAAACAGGG (2)
GTCAGTTCTT
GTTTTAAAAA (3)
73.90.0739
P1 cortexCAAAAAAAAA (2)
GCCAGTTCTT (6)
GGAAACAGGG (2)
GTCAGTTCTT
49.90.0499
HypothalamusCAAAAAAAAA (2)
CACTGCCGTC (2)
CAGTTGCTGG (3)
CTACGGGAGT (2)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GGAAACAGGG (2)
61.40.0614
E12.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CTTGTCACTC (3)
GGAAACAGGG (2)
GTGGCACAGA (2)
GTTTTAAAAA (3)
33.90.0339
E14.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CTTGTCACTC (3)
GGAAACAGGG (2)
GTGGCACAGA (2)
GTTTTAAAAA (3)
TCTTCATTAG (2)
25.40.0254
E16.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CAGTTGCTGG (3)
CTTGTCACTC (3)
GTTTTAAAAA (3)
23.50.0235
E18.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GTCAGTTCTT
GTTTTAAAAA (3)
76.40.0764
P0.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CACTGCCGTC (2)
GCCAGTTCTT (6)
151.20.1512
P2.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CTTGTCACTC (3)
GTGGCACAGA (2)
GTTTTAAAAA (3)
63.40.0634
P4.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CTACGGGAGT (2)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GGAAACAGGG (2)
GTTTTAAAAA (3)
65.40.0654
P6.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CAGTTGCTGG (3)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GGAAACAGGG (2)
GTGGCACAGA (2)
GTTTTAAAAA (3)
43.50.0435
P10.5 crx- retinaCAAAAAAAAA (2)
CAGTTGCTGG (3)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
22.40.0224
P10.5 crx+ retinaCAAAAAAAAA (2)
CACTGCCGTC (2)
CTTGTCACTC (3)
GTGGCACAGA (2)
480.048
Adult retinalCAAAAAAAAA (2)
CTTGTCACTC (3)
GCCAGTTCTT (6)
GTGGCACAGA (2)
TCTTCATTAG (2)
37.20.0372
ONLCAAAAAAAAA (2)
GTTTTAAAAA (3)
210.021