Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.201455 1700042D18RikRIKEN cDNA 1700042D18 gene 13    67324 
 Mm.201455 Scamp1secretory carrier membrane protein 1 13    107767 
 Gene Ontology exocytosis | integral to membrane | protein transport | synaptic vesicle | synaptic vesicle membrane | transport | zymogen granule membrane
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 85 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCATAAATAAA
CCTTTGATCC (4)
GGAGAAAAAA (6)
GTTAAAAAAA (2)
TTTTCAGTGG (4)
17.90.0179
Cb medulloblastomaCCTTTGATCC (4)
GGAGAAAAAA (6)
GTTAAAAAAA (2)
TCACGTCTTA (2)
TGACACCGGG (2)
TTTTCAGTGG (4)
48.40.0484
P8 GC+1d cultureCCTTTGATCC (4)
GTTAAAAAAA (2)
TTTTCAGTGG (4)
22.80.0228
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTGATCC (4)
GCTGCAGTAA (2)
GGAGAAAAAA (6)
GTTAAAAAAA (2)
TGACACCGGG (2)
TGTGGCTGCT (4)
TTTTCAGTGG (4)
28.30.0283
3T3 fibroblastsGGTGGGTGGT
3.50.0035
E15 cortexTCACGTCTTA (2)
TGACACCGGG (2)
TGTGGCTGCT (4)
14.70.0147
P1 cortexCCTTTGATCC (4)
GTTAAAAAAA (2)
TTTTCAGTGG (4)
27.20.0272
HypothalamusGAGGGCGTTT (2)
GTTAAAAAAA (2)
TCACGTCTTA (2)
TGTGGCTGCT (4)
TTTTCAGTGG (4)
23.50.0235
E12.5 retinaCCTTTGATCC (4)
GCTGCAGTAA (2)
GTTAAAAAAA (2)
11.30.0113
E14.5 retinaCCTTTGATCC (4)
GAGGGCGTTT (2)
GCTGTAAAGC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGTGGCTGCT (4)
290.029
E16.5 retinaCCTTTGATCC (4)
GTTAAAAAAA (2)
TGTGGCTGCT (4)
23.50.0235
E18.5 retinaCCTTTGATCC (4)
GGTGGGTGGT
GTTAAAAAAA (2)
TGTGGCTGCT (4)
TTTTCAGTGG (4)
36.30.0363
P0.5 retinaCATAAATAAA
CCTTTGATCC (4)
GCTGTAAAGC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TTTTCAGTGG (4)
13.80.0138
P2.5 retinaCCTTTGATCC (4)
GAGGGCGTTT (2)
GGAGAAAAAA (6)
GTTAAAAAAA (2)
TTTTCAGTGG (4)
26.40.0264
P4.5 retinaCATAAATAAA
CCTTTGATCC (4)
GTTAAAAAAA (2)
TGACACCGGG (2)
TGTGGCTGCT (4)
TTTTCAGTGG (4)
31.70.0317
P6.5 retinaCCTTTGATCC (4)
GGAGAAAAAA (6)
GTTAAAAAAA (2)
TGTGGCTGCT (4)
TTTTCAGTGG (4)
400.04
P10.5 crx- retinaGTTAAAAAAA (2)
TTTTCAGTGG (4)
130.013
P10.5 crx+ retinaCCTTTGATCC (4)
GCTGTAAAGC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TTTTCAGTGG (4)
36.60.0366
Adult retinalCATAAATAAA
GCTGCAGTAA (2)
GCTGTAAAGC (2)
GGAGAAAAAA (6)
TGTGGCTGCT (4)
TTTTCAGTGG (4)
13.20.0132
ONLCCTTTGATCC (4)
GTTAAAAAAA (2)
TTTTCAGTGG (4)
15.20.0152