Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.209491 2610318I01RikRIKEN cDNA 2610318I01 gene 3    214459 
 Human Homolog C1orf39[chromosome 1 open reading frame 39]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 58 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGATCAAACTA (3)
GTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
TGAGCTGTCT (2)
11.40.0114
Cb medulloblastomaGTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
9.20.0092
P8 GC+1d cultureCAGATTTTTT (2)
GATCAAACTA (3)
GTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
TGAGCTGTCT (2)
28.50.0285
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGAACTTG
CAGATTTTTT (2)
GTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
TGAGCTGTCT (2)
24.60.0246
3T3 fibroblastsTGAGCTGTCT (2)
3.50.0035
E15 cortexGTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
29.60.0296
P1 cortexGTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
TGAGCTGTCT (2)
31.70.0317
HypothalamusGTCAAAAAAA
TGAGCTGTCT (2)
7.20.0072
E12.5 retinaGTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
TGAGCTGTCT (2)
5.70.0057
E14.5 retinaGTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
12.70.0127
E16.5 retinaAAGGAACTTG
CAGATTTTTT (2)
GTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
16.30.0163
E18.5 retinaAAGGAACTTG
GTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
TGAGCTGTCT (2)
43.60.0436
P0.5 retinaGTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
9.90.0099
P2.5 retinaAAGGAACTTG
GATCAAACTA (3)
GTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
21.20.0212
P4.5 retinaGTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
11.90.0119
P6.5 retinaAAGGAACTTG
GATCAAACTA (3)
GTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
15.10.0151
P10.5 crx- retinaGTCAAAAAAA
3.70.0037
P10.5 crx+ retinaGTCAAAAAAA
GTCAGTTAAA (2)
TGAGCTGTCT (2)
11.50.0115
Adult retinalGTCAAAAAAA
TGAGCTGTCT (2)
9.30.0093
ONLGATCAAACTA (3)
GTCAAAAAAA
TGAGCTGTCT (2)
5.70.0057