Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.209750	1110054H05Rik	RIKEN cDNA 1110054H05 gene	11		68837
Mm.209750	6230415M23Rik	RIKEN cDNA 6230415M23 gene	11		109037
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 146 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CTTGCCCAGG (2) GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TCAACACGCA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 135.4 0.1354 Cb medulloblastoma AGGCCAGGGG (3) ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CTTGCCCAGG (2) GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 344.4 0.3444 P8 GC+1d culture ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 122.1 0.1221 P8 GC+SHH+1d culture AACCCAGGTG (3) AGGCCAGGGG (3) ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC GAAAAAAAAA (2) GCTTTGTGCG GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 192.1 0.1921 3T3 fibroblasts ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CCTACAGCAG TCAACACGCA (2) TGGTTGCTGG 238.3 0.2383 E15 cortex ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CCTACAGCAG GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 371 0.371 P1 cortex CTTGCCCAGG (2) GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TCAACACGCA (2) TGGTTGCTGG 145.4 0.1454 Hypothalamus AACCCAGGTG (3) AGGCCAGTGG ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 454.6 0.4546 E12.5 retina ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CTTGCCCAGG (2) GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TCAACACGCA (2) TGGTTGCTGG 221.6 0.2216 E14.5 retina AACCCAGGTG (3) ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 994.7 0.9947 E16.5 retina AACCCAGGTG (3) ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CCTACAGCAG GAAAAAAAAA (2) GCTTTGTGCG GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 811.2 0.8112 E18.5 retina AGGCCAGGGG (3) ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC GAAAAAAAAA (2) GCTTTGTGCG GGAAAAAAAA (2) TCAACACGCA (2) TGGTTGCTGG 358.3 0.3583 P0.5 retina ATGCGAGTGA (2) CTTGCCCAGG (2) GAAAAAAAAA (2) GCTTTGTGCG GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 253.2 0.2532 P2.5 retina CAGCCTCAGC CTCAGGTTCC GAAAAAAAAA (2) GCTTTGTGCG GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 267.5 0.2675 P4.5 retina ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CTCAGGTTCC CTTGCCCAGG (2) GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 237.8 0.2378 P6.5 retina AACCCAGGTG (3) ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG 221.7 0.2217 P10.5 crx- retina ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 321.4 0.3214 P10.5 crx+ retina AGGCCAGGGG (3) ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 180.6 0.1806 Adult retinal AGGCCAGGGG (3) AGGCCAGTGG ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CTCAGGTTCC GAAAAAAAAA (2) GCTTTGTGCG GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 267 0.267 ONL ATGCGAGTGA (2) CAGCCTCAGC CTTGCCCAGG (2) GAAAAAAAAA (2) GCTTTGTGCG GGAAAAAAAA (2) TGGTTGCTGG TGTGTGCCCA (3) 459.5 0.4595