Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.211211 D12Mgi15DNA Segment, Chr 12, Mouse Genome Informatics 15 12    104928 
 Mm.211211 2310032D16RikRIKEN cDNA 2310032D16 gene 2    74182 
 Mm.211211 E030016H06RikRIKEN cDNA E030016H06 gene 2    402722 
 Mm.211211 Prei4preimplantation protein 4     19071 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 98 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGAAAAATA (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
TATTGACAGA (4)
35.90.0359
Cb medulloblastomaAGCAGAAATT (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
GTAGCTCACA (3)
39.30.0393
P8 GC+1d cultureCAGAAAAATA (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
TGTTGGTTCA (6)
45.70.0457
P8 GC+SHH+1d cultureACTTTAATAC (4)
AGCAGAAATT (4)
CAGAAAAATA (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
CTGTGGCTCT (2)
GTAGCTCACA (3)
TATTGACAGA (4)
TGTTGGTTCA (6)
37.40.0374
3T3 fibroblastsCGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
GTAGCTCACA (3)
280.028
E15 cortexCGCCACCACA (3)
GTAGCTCACA (3)
34.60.0346
P1 cortexCGCCACCACA (3)
GTAGCTCACA (3)
18.10.0181
HypothalamusATCCAGAAAT (4)
CGCCACCAAA (5)
CTGTGGCTCT (2)
GTAGCTCACA (3)
TATTGACAGA (4)
43.40.0434
E12.5 retinaCAGAAAAATA (4)
CGCCACCAAA (5)
CTGTGGCTCT (2)
GTAGCTCACA (3)
TGTTGGTTCA (6)
37.60.0376
E14.5 retinaCGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
GTAGCTCACA (3)
38.20.0382
E16.5 retinaCAGAAAAATA (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
TGTTGGTTCA (6)
63.40.0634
E18.5 retinaCGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
30.90.0309
P0.5 retinaCAGAAAAATA (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
GTAGCTCACA (3)
43.30.0433
P2.5 retinaACTTTAATAC (4)
AGCAGAAATT (4)
ATCCAGAAAT (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
TATTGACAGA (4)
54.70.0547
P4.5 retinaCAGAAAAATA (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
TATTGACAGA (4)
53.60.0536
P6.5 retinaACTTTAATAC (4)
CGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
TATTGACAGA (4)
400.04
P10.5 crx- retinaACTTTAATAC (4)
ATCCAGAAAT (4)
CGCCACCAAA (5)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
37.20.0372
P10.5 crx+ retinaATCCAGAAAT (4)
CAGAAAAATA (4)
CGCCACCAAA (5)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
TGTTGGTTCA (6)
460.046
Adult retinalCGCCACCAAA (5)
CGCCACCACA (3)
GTAGCTCACA (3)
TGTTGGTTCA (6)
35.30.0353
ONLCGCCACCACA (3)
CTTTTAGGAT (4)
GTAGCTCACA (3)
TATTGACAGA (4)
30.60.0306