Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.213025 0610041G09RikRIKEN cDNA 0610041G09 gene 19    68377 
 Mm.213025 Acta2actin, alpha 2, smooth muscle, aorta 19    11475 
 Gene Ontology actin cytoskeleton | actin filament | cytoskeleton | cytoskeleton organization and biogenesis | motor activity | muscle development | structural constituent of cytoskeleton | structural molecule activity
 Human Homolog ACTA2[actin, alpha 2, smooth muscle, aorta]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 114 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGA (2)
GAGAAGATCT (2)
TACCCAGGCA (2)
TGCTACCCTT (3)
89.80.0898
Cb medulloblastomaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGA (2)
AAGATCCTGG (2)
AAGTGTGAAA
GAGAAGATCT (2)
TAACTCTGGA
TGCTACCCTT (3)
43.90.0439
P8 GC+1d cultureAAACTGGAAT (2)
AAAGACCTTG
AAGATCAAGA (2)
AAGTGTGAAA
GAAGAGCCAG (3)
GCGCAAGGCG (2)
TACCCAGGCA (2)
TGCTACCCTT (3)
38.70.0387
P8 GC+SHH+1d cultureAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGA (2)
AAGTGTGAAA
GAGAAGATCT (2)
GCGCAAGGCG (2)
TGCTACCCTT (3)
28.20.0282
3T3 fibroblastsAAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGA (2)
CGTGACTTTT (3)
GAGAAGATCT (2)
GCGCAAGGCG (2)
TGCTACCCTT (3)
133.20.1332
E15 cortexAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGA (2)
GAGAAGATCT (2)
TACCCAGGCA (2)
138.40.1384
P1 cortexAAGATCAAGA (2)
63.60.0636
HypothalamusAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGA (2)
AAGATCCTGG (2)
AAGTGTGAAA
GAAGAGCCAG (3)
GAGAAGATCT (2)
TAACCCAGGC
TAACTCTGGA
TGCTACCCTT (3)
34.30.0343
E12.5 retinaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGTGTGAAA
AGATCTGACT
TAACTCTGGA
58.30.0583
E14.5 retinaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGA (2)
AAGATCCTGG (2)
AAGTGTGAAA
AGATCTGACT
TAACTCTGGA
TACCCAGGCA (2)
21.70.0217
E16.5 retinaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGTGTGAAA
TACCCAGGCA (2)
23.50.0235
E18.5 retinaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGG (2)
AAGTGTGAAA
TACCCAGGCA (2)
200.02
P0.5 retinaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGTGTGAAA
TACCCAGGCA (2)
TGCTACCCTT (3)
35.50.0355
P2.5 retinaAAGATCAAGA (2)
AAGTGTGAAA
TAACTCTGGA
TGCTACCCTT (3)
14.20.0142
P4.5 retinaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGTGTGAAA
GCGCAAGGCG (2)
TAACTCTGGA
25.80.0258
P6.5 retinaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGTGTGAAA
GAGAAGATCT (2)
TACCCAGGCA (2)
TGCTACCCTT (3)
21.80.0218
P10.5 crx- retinaAAACTGGAAT (2)
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGG (2)
AAGTGTGAAA
AGATCTGACT
TAACCCAGGC
29.80.0298
P10.5 crx+ retinaAAGATCAAGA (2)
AAGTGTGAAA
GAAGAGCCAG (3)
GAGAAGATCT (2)
TACCCAGGCA (2)
230.023
Adult retinalAAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGG (2)
AAGTGTGAAA
TAACTCTGGA
TGCTACCCTT (3)
13.10.0131
ONLAAAGACCTTG
AAGATCAAGA (2)
AAGATCCTGG (2)
AAGTGTGAAA
AGATCTGACT
15.20.0152