Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.213298 1700016B15RikRIKEN cDNA 1700016B15 gene 7    69427 
 Mm.213298 9030624J02RikRIKEN cDNA 9030624J02 gene 7    71517 
 Human Homolog MGC16824[esophageal cancer associated protein]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 87 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATCATCTGT (2)
AGAATTTGGT (2)
CAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
TCTGGGTTTA (3)
TTTGCAGCCA (4)
570.057
Cb medulloblastomaAGAATTTGGT (2)
AGCCAGGACA (3)
CAAAAAAAAA (2)
CCAGAACCCA (3)
CTGCAAAAAA
TCTGGGTTTA (3)
TTTGCAGCCA (4)
124.80.1248
P8 GC+1d cultureAGAATTTGGT (2)
CAAAAAAAAA (2)
CCAGAACCCA (3)
CTGCAAAAAA
TCTGGGTTTA (3)
TTTGCAGCCA (4)
58.20.0582
P8 GC+SHH+1d cultureCAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
TTTGCAGCCA (4)
70.20.0702
3T3 fibroblastsGCCCAGAAGT (4)
TTTGCAGCCA (4)
17.50.0175
E15 cortexCAAAAAAAAA (2)
TTTGCAGCCA (4)
39.50.0395
P1 cortexAGAATTTGGT (2)
CAAAAAAAAA (2)
GCCCAGAAGT (4)
TCAGAGAAGG (3)
TCTGGGTTTA (3)
49.90.0499
HypothalamusCAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
TTTTGTGTTT (2)
470.047
E12.5 retinaAGAATTTGGT (2)
CAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
TCTGGGTTTA (3)
TTTGCAGCCA (4)
37.60.0376
E14.5 retinaAATCATCTGT (2)
AGAATTTGGT (2)
CAAAAAAAAA (2)
TTTGCAGCCA (4)
14.50.0145
E16.5 retinaAGAATTTGGT (2)
AGCCAGGACA (3)
CAAAAAAAAA (2)
TCTGGGTTTA (3)
TTTGCAGCCA (4)
TTTTGTGTTT (2)
19.90.0199
E18.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
TCTGGGTTTA (3)
TTTGCAGCCA (4)
490.049
P0.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CCAGAACCCA (3)
CTGCAAAAAA
TTTGCAGCCA (4)
145.30.1453
P2.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
TCTGGGTTTA (3)
TTTGCAGCCA (4)
59.80.0598
P4.5 retinaAGAATTTGGT (2)
CAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
TTTGCAGCCA (4)
51.60.0516
P6.5 retinaCAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
TCTGGGTTTA (3)
TTTTGTGTTT (2)
36.80.0368
P10.5 crx- retinaAATCATCTGT (2)
AGAATTTGGT (2)
CAAAAAAAAA (2)
TCAGAGAAGG (3)
TTTGCAGCCA (4)
TTTTGTGTTT (2)
29.80.0298
P10.5 crx+ retinaAGCCAGGACA (3)
CAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
TTTGCAGCCA (4)
38.40.0384
Adult retinalAATCATCTGT (2)
AGAATTTGGT (2)
CAAAAAAAAA (2)
CTGCAAAAAA
27.90.0279
ONLCAAAAAAAAA (2)
CCAGAACCCA (3)
CTGCAAAAAA
TCAGAGAAGG (3)
TTTGCAGCCA (4)
28.60.0286