Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.215034 RNU19RNA, U19 small nucleolar 18    436583 
 Mm.215034 1110061A14RikRIKEN cDNA 1110061A14 gene 18    68827 
 Mm.215034 AY223547cDNA sequence AY223547     448986 
 Mm.215034 Matr3matrin 3 18  18 15.0 cM  17184 
 Mm.215034 2810017I02RikRIKEN cDNA 2810017I02 gene 18    69967 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 229 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (355)52.20.0522
P8 Cb GCCAAAAAAAAA (157)47.30.0473
P8 Cb GCTATAATCTGT (5)24.50.0245
P8 Cb GCTTTGGATGTT (8)8.20.0082
P8 Cb GCTGACCTTTGT (7)4.90.0049
P8 Cb GCTTGAAAAAAA (15)4.90.0049
P8 Cb GCAATTACAAGC (8)3.30.0033
P8 Cb GCCTGCTGTGGA (8)3.30.0033
P8 Cb GCAATGAAGTTC (5)1.60.0016
P8 Cb GCAATTAGAAGC (6)1.60.0016
P8 Cb GCACATTAAAAG (7)1.60.0016
P8 Cb GCACCCTGTGAA (7)1.60.0016
P8 Cb GCAGGTCACCCT (6)1.60.0016
P8 Cb GCCAAAAAGGCA (6)1.60.0016
P8 Cb GCGGAAAATAAA (15)1.60.0016
P8 Cb GCTGGTGCCTCT (7)1.60.0016
Cb medulloblastomaCAAAAAAAAA (157)92.50.0925
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (355)41.60.0416
Cb medulloblastomaTATAATCTGT (5)6.90.0069
Cb medulloblastomaTGGCCGGCTA (5)6.90.0069
Cb medulloblastomaTTTGGATGTT (8)6.90.0069
Cb medulloblastomaCAGGATTCCT (5)4.60.0046
Cb medulloblastomaCTTTAACAAA (5)4.60.0046
Cb medulloblastomaTGGTGCCTCT (7)4.60.0046
Cb medulloblastomaAATGAAGTTC (5)2.30.0023
Cb medulloblastomaACCCTGTGAA (7)2.30.0023
Cb medulloblastomaCAAAAAGGCA (6)2.30.0023
Cb medulloblastomaGAAGTCGTTC (6)2.30.0023
Cb medulloblastomaGTGGCATATA (13)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTGAAAAAAA (15)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCAAAAAAAAA (157)37.70.0377
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (355)320.032
P8 GC+1d cultureTATAATCTGT (5)14.80.0148
P8 GC+1d cultureAATTACAAGC (8)12.60.0126
P8 GC+1d cultureTTTGGATGTT (8)6.80.0068
P8 GC+1d cultureTGGTGCCTCT (7)5.70.0057
P8 GC+1d cultureCTGTTTAGAT (8)3.40.0034
P8 GC+1d cultureACCCTGTGAA (7)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGCCGGCTA (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAATGAAGTTC (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCAGGATTCCT (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCTTTAACAAA (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGTGTGTGAG (13)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTTGAAAAAAA (15)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCAAAAAAAAA (157)58.50.0585
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCC (355)25.80.0258
P8 GC+SHH+1d cultureTATAATCTGT (5)17.60.0176
P8 GC+SHH+1d cultureTTTGGATGTT (8)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTGCCTCT (7)10.50.0105
P8 GC+SHH+1d cultureTTGAAAAAAA (15)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureACCCTGTGAA (7)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureAATTACAAGC (8)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureAATGAAGTTC (5)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureAATTAGAAGC (6)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCTGTTTAGAT (8)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureAGGTCACCCT (6)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCTTTAACAAA (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGAAGTCGTTC (6)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGGCCGGCTA (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGTGTGAG (13)1.20.0012
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (355)70.10.0701
3T3 fibroblastsTGGTGCCTCT (7)210.021
3T3 fibroblastsAATTAGAAGC (6)3.50.0035
E15 cortexCCTTTAATCC (355)54.40.0544
E15 cortexCAAAAAAAAA (157)34.60.0346
E15 cortexCTTCTTGAAT (7)4.90.0049
E15 cortexGTGGCATATA (13)4.90.0049
E15 cortexTATAATCTGT (5)4.90.0049
P1 cortexCCTTTAATCC (355)154.50.1545
P1 cortexTATAATCTGT (5)45.50.0455
P1 cortexCAAAAAAAAA (157)22.70.0227
P1 cortexCAGGATTCCT (5)9.10.0091
P1 cortexAATTACAAGC (8)4.50.0045
P1 cortexACATTAAAAG (7)4.50.0045
P1 cortexTGGCCGGCTA (5)4.50.0045
P1 cortexTTTGGATGTT (8)4.50.0045
HypothalamusCAAAAAAAAA (157)39.80.0398
HypothalamusCCTTTAATCC (355)19.90.0199
HypothalamusTATAATCTGT (5)10.90.0109
HypothalamusAATTACAAGC (8)9.10.0091
HypothalamusCAGGATTCCT (5)9.10.0091
HypothalamusTTTGGATGTT (8)9.10.0091
HypothalamusGGAAAATAAA (15)1.80.0018
HypothalamusTGGCCGGCTA (5)1.80.0018
E12.5 retinaCCTTTAATCC (355)75.10.0751
E12.5 retinaCAAAAAAAAA (157)22.50.0225
E12.5 retinaACCCTGTGAA (7)11.30.0113
E12.5 retinaTATAATCTGT (5)11.30.0113
E12.5 retinaAATTACAAGC (8)5.60.0056
E12.5 retinaCTTCTTGAAT (7)1.90.0019
E12.5 retinaTGGTGCCTCT (7)1.90.0019
E12.5 retinaTTGAAAAAAA (15)1.90.0019
E14.5 retinaCCTTTAATCC (355)120.30.1203
E14.5 retinaCAAAAAAAAA (157)9.10.0091
E14.5 retinaTATAATCTGT (5)9.10.0091
E14.5 retinaTTTGGATGTT (8)9.10.0091
E14.5 retinaAATTACAAGC (8)5.50.0055
E14.5 retinaGAAAATGGGA (6)5.50.0055
E14.5 retinaTGGTGCCTCT (7)3.60.0036
E14.5 retinaAATTAGAAGC (6)1.80.0018
E14.5 retinaAGTCTGGAGC (6)1.80.0018
E14.5 retinaCTGTTTAGAT (8)1.80.0018
E14.5 retinaGAAGTCGTTC (6)1.80.0018
E16.5 retinaCCTTTAATCC (355)68.80.0688
E16.5 retinaCAAAAAAAAA (157)9.10.0091
E16.5 retinaTATAATCTGT (5)9.10.0091
E16.5 retinaTTTGGATGTT (8)7.20.0072
E16.5 retinaTGGTGCCTCT (7)3.60.0036
E16.5 retinaAATTACAAGC (8)1.80.0018
E16.5 retinaCTTCTTGAAT (7)1.80.0018
E16.5 retinaCTTTAACAAA (5)1.80.0018
E16.5 retinaGTGGCATATA (13)1.80.0018
E16.5 retinaTGACCTTTGT (7)1.80.0018
E16.5 retinaTGGCCGGCTA (5)1.80.0018
E18.5 retinaCAAAAAAAAA (157)41.80.0418
E18.5 retinaCCTTTAATCC (355)23.60.0236
E18.5 retinaTATAATCTGT (5)12.70.0127
E18.5 retinaTTTGGATGTT (8)10.90.0109
E18.5 retinaCTGTTTAGAT (8)5.50.0055
E18.5 retinaTTGAAAAAAA (15)5.50.0055
E18.5 retinaTGTGTGTGAG (13)3.60.0036
E18.5 retinaAATTACAAGC (8)1.80.0018
E18.5 retinaACATTAAAAG (7)1.80.0018
E18.5 retinaTGGTGCCTCT (7)1.80.0018
P0.5 retinaCAAAAAAAAA (157)137.40.1374
P0.5 retinaCCTTTAATCC (355)72.60.0726
P0.5 retinaTATAATCTGT (5)15.70.0157
P0.5 retinaTTTGGATGTT (8)7.90.0079
P0.5 retinaCACAAAAAAT (6)3.90.0039
P0.5 retinaTGGTGCCTCT (7)3.90.0039
P0.5 retinaTTGAAAAAAA (15)3.90.0039
P0.5 retinaAATTACAAGC (8)20.002
P0.5 retinaCAGGATTCCT (5)20.002
P0.5 retinaCTGCTGTGGA (8)20.002
P0.5 retinaGGAAGGTCGG (6)20.002
P0.5 retinaTGTGTGTGAG (13)20.002
P2.5 retinaCCTTTAATCC (355)70.40.0704
P2.5 retinaCAAAAAAAAA (157)52.80.0528
P2.5 retinaTATAATCTGT (5)12.30.0123
P2.5 retinaTTTGGATGTT (8)8.80.0088
P2.5 retinaAATTACAAGC (8)5.30.0053
P2.5 retinaTGGTGCCTCT (7)5.30.0053
P2.5 retinaAATTAGAAGC (6)3.50.0035
P2.5 retinaACCCTGTGAA (7)3.50.0035
P2.5 retinaAATGAAGTTC (5)1.80.0018
P2.5 retinaAGGTCACCCT (6)1.80.0018
P2.5 retinaCACAAAAAAT (6)1.80.0018
P2.5 retinaCTGCTGTGGA (8)1.80.0018
P2.5 retinaCTGTTTAGAT (8)1.80.0018
P2.5 retinaCTTCTTGAAT (7)1.80.0018
P2.5 retinaGGAAAATAAA (15)1.80.0018
P2.5 retinaGTGGCATATA (13)1.80.0018
P4.5 retinaCCTTTAATCC (355)43.60.0436
P4.5 retinaCAAAAAAAAA (157)41.60.0416
P4.5 retinaTTTGGATGTT (8)17.80.0178
P4.5 retinaTATAATCTGT (5)11.90.0119
P4.5 retinaTTGAAAAAAA (15)7.90.0079
P4.5 retinaAATTACAAGC (8)20.002
P4.5 retinaACCCTGTGAA (7)20.002
P4.5 retinaAGGTCACCCT (6)20.002
P4.5 retinaAGTCTGGAGC (6)20.002
P4.5 retinaCAGGATTCCT (5)20.002
P4.5 retinaTGGTGCCTCT (7)20.002
P6.5 retinaCCTTTAATCC (355)700.07
P6.5 retinaCAAAAAAAAA (157)31.70.0317
P6.5 retinaTTTGGATGTT (8)13.30.0133
P6.5 retinaTATAATCTGT (5)100.01
P6.5 retinaTGGTGCCTCT (7)50.005
P6.5 retinaAATTACAAGC (8)3.30.0033
P6.5 retinaCTGTTTAGAT (8)3.30.0033
P6.5 retinaCTTTAACAAA (5)3.30.0033
P6.5 retinaACATTAAAAG (7)1.70.0017
P6.5 retinaACCCTGTGAA (7)1.70.0017
P6.5 retinaAGGTCACCCT (6)1.70.0017
P6.5 retinaGTGGCATATA (13)1.70.0017
P6.5 retinaTGACCTTTGT (7)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (355)63.20.0632
P10.5 crx- retinaAATTACAAGC (8)130.013
P10.5 crx- retinaCAAAAAAAAA (157)130.013
P10.5 crx- retinaTATAATCTGT (5)130.013
P10.5 crx- retinaTGGCCGGCTA (5)7.40.0074
P10.5 crx- retinaTTTGGATGTT (8)7.40.0074
P10.5 crx- retinaCAAAAAGGCA (6)3.70.0037
P10.5 crx- retinaAATGAAGTTC (5)1.90.0019
P10.5 crx- retinaAGGTCACCCT (6)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCACAAAAAAT (6)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCTGTTTAGAT (8)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGTGGCATATA (13)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTTGAAAAAAA (15)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCTTTAATCC (355)38.40.0384
P10.5 crx+ retinaCAAAAAAAAA (157)32.70.0327
P10.5 crx+ retinaTTTGGATGTT (8)23.10.0231
P10.5 crx+ retinaTATAATCTGT (5)15.40.0154
P10.5 crx+ retinaTGGCCGGCTA (5)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaCTGTTTAGAT (8)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTGGTGCCTCT (7)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaAATGAAGTTC (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAATTACAAGC (8)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAATTAGAAGC (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaACCCTGTGAA (7)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCAAAAAGGCA (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCTTTAACAAA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTGGCATATA (13)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGTGTGTGAG (13)1.90.0019
Adult retinalCCTTTAATCC (355)129.60.1296
Adult retinalCAAAAAAAAA (157)20.40.0204
Adult retinalTGGCCGGCTA (5)7.40.0074
Adult retinalCAGGATTCCT (5)5.60.0056
Adult retinalAATGAAGTTC (5)1.90.0019
Adult retinalAATTAGAAGC (6)1.90.0019
Adult retinalCAAAAAGGCA (6)1.90.0019
Adult retinalCTGCTGTGGA (8)1.90.0019
Adult retinalGGAAGGTCGG (6)1.90.0019
Adult retinalTATAATCTGT (5)1.90.0019
Adult retinalTTGAAAAAAA (15)1.90.0019
Adult retinalTTTGGATGTT (8)1.90.0019
ONLCCTTTAATCC (355)84.30.0843
ONLCAAAAAAAAA (157)17.20.0172
ONLTATAATCTGT (5)7.70.0077
ONLTTTGGATGTT (8)5.70.0057
ONLACCCTGTGAA (7)3.80.0038
ONLTTGAAAAAAA (15)3.80.0038
ONLAATGAAGTTC (5)1.90.0019
ONLAGGTCACCCT (6)1.90.0019
ONLAGTCTGGAGC (6)1.90.0019
ONLCACAAAAAAT (6)1.90.0019
ONLCAGGATTCCT (5)1.90.0019
ONLCTTTAACAAA (5)1.90.0019
ONLGGAAGGTCGG (6)1.90.0019