Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.218233 Myh10myosin heavy chain 10, non-muscle 11  11 40.0 cM  77579 
 Mm.218233 C78226expressed sequence C78226 11    97703 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 142 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (658)203.90.2039
P8 Cb GCTGGTTGCTGG (369)68.50.0685
P8 Cb GCTGAAAAAAAA (81)27.70.0277
P8 Cb GCGGTTTGGAAT (6)11.40.0114
P8 Cb GCTATAAATATA (4)3.30.0033
P8 Cb GCAAGGGCCAGT (3)1.60.0016
P8 Cb GCCCAAGGGTCC (4)1.60.0016
P8 Cb GCCCTGTCTACT (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (658)797.80.7978
Cb medulloblastomaTGGTTGCTGG (369)113.30.1133
Cb medulloblastomaTGAAAAAAAA (81)78.60.0786
Cb medulloblastomaGGTTTGGAAT (6)11.60.0116
Cb medulloblastomaCCAAGGGTCC (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaCCTGTCTACT (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (658)204.30.2043
P8 GC+1d cultureTGGTTGCTGG (369)57.10.0571
P8 GC+1d cultureTGAAAAAAAA (81)26.30.0263
P8 GC+1d cultureCCTGTCTACT (5)9.10.0091
P8 GC+1d cultureGGTTTGGAAT (6)6.80.0068
P8 GC+1d cultureAAGGGCCAGT (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCCAAGGGTCC (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCCGCTCTCTT (6)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGATGGCAAAC (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTATAAATATA (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (658)278.70.2787
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTTGCTGG (369)890.089
P8 GC+SHH+1d cultureTGAAAAAAAA (81)57.40.0574
P8 GC+SHH+1d cultureCCTGTCTACT (5)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureGGTTTGGAAT (6)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureCCAAGGGTCC (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGGCCAGT (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureACTGAGGAGG (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTATAAATATA (4)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGGTTGCTGG (369)220.80.2208
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (658)280.028
3T3 fibroblastsCCTGTCTACT (5)210.021
3T3 fibroblastsCCGCTCTCTT (6)140.014
3T3 fibroblastsCCAAGGGTCC (4)70.007
3T3 fibroblastsGAGCTGCTCA (9)70.007
3T3 fibroblastsTGAAAAAAAA (81)70.007
E15 cortexTGGTTGCTGG (369)277.10.2771
E15 cortexAAAAAAAAAA (658)212.80.2128
E15 cortexTGAAAAAAAA (81)29.70.0297
E15 cortexCCTGTCTACT (5)14.80.0148
E15 cortexGAGCTGCTCA (9)4.90.0049
P1 cortexAAAAAAAAAA (658)245.40.2454
P1 cortexTGGTTGCTGG (369)86.40.0864
P1 cortexGGTTTGGAAT (6)18.20.0182
P1 cortexCCAAGGGTCC (4)9.10.0091
P1 cortexCCTGTCTACT (5)9.10.0091
P1 cortexTGAAAAAAAA (81)4.50.0045
HypothalamusTGGTTGCTGG (369)349.60.3496
HypothalamusAAAAAAAAAA (658)123.20.1232
HypothalamusTGAAAAAAAA (81)36.20.0362
HypothalamusTGGGCCCCTG (4)9.10.0091
HypothalamusGAGCTGCTCA (9)3.60.0036
HypothalamusGCTGGAACTT (3)3.60.0036
HypothalamusCCTGTCTACT (5)1.80.0018
HypothalamusGATGGCAAAC (3)1.80.0018
HypothalamusGGTTTGGAAT (6)1.80.0018
E12.5 retinaTGGTTGCTGG (369)157.70.1577
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (658)138.90.1389
E12.5 retinaTGAAAAAAAA (81)31.90.0319
E12.5 retinaGGTTTGGAAT (6)9.40.0094
E12.5 retinaCCTGTCTACT (5)7.50.0075
E12.5 retinaTATAAATATA (4)3.80.0038
E12.5 retinaCCAAGGGTCC (4)1.90.0019
E14.5 retinaTGGTTGCTGG (369)936.50.9365
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (658)94.70.0947
E14.5 retinaTGAAAAAAAA (81)49.20.0492
E14.5 retinaCCTGTCTACT (5)5.50.0055
E14.5 retinaGGTTTGGAAT (6)5.50.0055
E16.5 retinaTGGTTGCTGG (369)767.90.7679
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (658)43.50.0435
E16.5 retinaTGAAAAAAAA (81)16.30.0163
E16.5 retinaGGTTTGGAAT (6)9.10.0091
E16.5 retinaCCTGTCTACT (5)5.40.0054
E16.5 retinaTGGGCCCCTG (4)5.40.0054
E16.5 retinaACTGAGGAGG (4)1.80.0018
E16.5 retinaCCAAGGGTCC (4)1.80.0018
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (658)374.70.3747
E18.5 retinaTGGTTGCTGG (369)252.80.2528
E18.5 retinaTGAAAAAAAA (81)74.60.0746
E18.5 retinaGGTTTGGAAT (6)9.10.0091
E18.5 retinaAAGGGCCAGT (3)1.80.0018
E18.5 retinaCCTGTCTACT (5)1.80.0018
E18.5 retinaTATAAATATA (4)1.80.0018
P0.5 retinaTGGTTGCTGG (369)190.40.1904
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (658)117.80.1178
P0.5 retinaTGAAAAAAAA (81)15.70.0157
P0.5 retinaCCTGTCTACT (5)13.70.0137
P0.5 retinaGGTTTGGAAT (6)3.90.0039
P0.5 retinaCCAAGGGTCC (4)20.002
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (658)329.10.3291
P2.5 retinaTGGTTGCTGG (369)165.40.1654
P2.5 retinaTGAAAAAAAA (81)42.20.0422
P2.5 retinaGGTTTGGAAT (6)3.50.0035
P2.5 retinaTGGGCCCCTG (4)3.50.0035
P2.5 retinaCCAAGGGTCC (4)1.80.0018
P2.5 retinaGATGGCAAAC (3)1.80.0018
P2.5 retinaTATAAATATA (4)1.80.0018
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (658)283.30.2833
P4.5 retinaTGGTTGCTGG (369)150.60.1506
P4.5 retinaTGAAAAAAAA (81)43.60.0436
P4.5 retinaCCTGTCTACT (5)40.004
P4.5 retinaGGTTTGGAAT (6)20.002
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (658)266.80.2668
P6.5 retinaTGGTTGCTGG (369)156.70.1567
P6.5 retinaTGAAAAAAAA (81)33.30.0333
P6.5 retinaGCTGGAACTT (3)1.70.0017
P6.5 retinaGGTTTGGAAT (6)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGGTTGCTGG (369)280.50.2805
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (658)44.60.0446
P10.5 crx- retinaCCTGTCTACT (5)20.40.0204
P10.5 crx- retinaGGTTTGGAAT (6)9.30.0093
P10.5 crx- retinaTGAAAAAAAA (81)9.30.0093
P10.5 crx- retinaCCAAGGGTCC (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGAGCTGCTCA (9)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTATAAATATA (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGGGCCCCTG (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGTTGCTGG (369)101.90.1019
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (658)96.10.0961
P10.5 crx+ retinaTGAAAAAAAA (81)19.20.0192
P10.5 crx+ retinaCCGCTCTCTT (6)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaCCTGTCTACT (5)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaCCAAGGGTCC (4)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaACTGAGGAGG (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCTGGAACTT (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGGCCCCTG (4)1.90.0019
Adult retinalTGGTTGCTGG (369)214.80.2148
Adult retinalAAAAAAAAAA (658)57.40.0574
Adult retinalCCTGTCTACT (5)14.80.0148
Adult retinalTGAAAAAAAA (81)130.013
Adult retinalGGTTTGGAAT (6)5.60.0056
Adult retinalCCAAGGGTCC (4)3.70.0037
Adult retinalGCTGGAACTT (3)1.90.0019
ONLTGGTTGCTGG (369)398.40.3984
ONLAAAAAAAAAA (658)103.40.1034
ONLTGAAAAAAAA (81)19.20.0192
ONLCCAAGGGTCC (4)3.80.0038
ONLCCTGTCTACT (5)3.80.0038
ONLTATAAATATA (4)1.90.0019