Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.218473 Tde1tumor differentially expressed 1 2    26943 
 Mm.218473 0610039K10RikRIKEN cDNA 0610039K10 gene 2    68386 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 119 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACCAATGAAC (2)
ATGACAGAAG (2)
ATGGACTTTA
GTGACGCCGG (2)
TCAGTTTATT (2)
29.30.0293
Cb medulloblastomaAACTACAGCT (2)
ACCAATGAAC (2)
ATCAATGAAC (2)
CCTTTGACTT (2)
CCTTTTGGGT
GTGACGCCGG (2)
TCAGTTTATT (2)
TGTCAAAGCA (2)
478.50.4785
P8 GC+1d cultureAACTACAGCT (2)
ACCAAAGAAA
ACCAATGAAC (2)
AGCTCAGTGT
ATGACAGAAG (2)
ATGGACTTTA
CCTTTGACTT (2)
TACTTTTGGA
TCAGTTTATT (2)
TGTCAAAGCA (2)
62.70.0627
P8 GC+SHH+1d cultureAACTACAGCT (2)
ACCAAAGAAA
ACCAATGAAC (2)
ATGACAGAAG (2)
ATGGACTTTA
TCAGTTTATT (2)
TGAGGCCTTT
TGTCAAAGCA (2)
TTAAAAAACA (2)
TTAAAACAAA (3)
43.50.0435
3T3 fibroblastsAACTACAGCT (2)
70.007
E15 cortexAGAAGGAGGG (2)
ATGACAGAAG (2)
9.80.0098
P1 cortexAACTACAGCT (2)
ACCAATGAAC (2)
AGAAGGAGGG (2)
ATGACAGAAG (2)
TCAGTTTATT (2)
27.10.0271
HypothalamusACCAATGAAC (2)
TACTTTTGGA
TCAGTTTATT (2)
8530.853
E12.5 retinaACCAATGAAC (2)
ATGTACAAGG (2)
ATTTTTGTGT
TCAGTTTATT (2)
20.70.0207
E14.5 retinaAACTACAGCT (2)
ACCAATGAAC (2)
ATGACAGAAG (2)
ATTTTTGTGT
TCAGTTTATT (2)
TGAGGCCTTT
TTAAAAAACA (2)
TTAAAACAAA (3)
41.70.0417
E16.5 retinaACCAATGAAC (2)
AGCTCAGTGT
ATGACAGAAG (2)
GTGACGCCGG (2)
TACTTTTGGA
TCAGTTTATT (2)
TGTCAAAGCA (2)
TTAAAAAACA (2)
28.90.0289
E18.5 retinaACCAATGAAC (2)
GTGACGCCGG (2)
TCAGTTTATT (2)
TGTCAAAGCA (2)
18.10.0181
P0.5 retinaAGCTCAGTGT
ATGACAGAAG (2)
ATGTACAAGG (2)
GGCAGCCCCT (2)
TCAGTTTATT (2)
TTAAAACAAA (3)
21.70.0217
P2.5 retinaACCAATGAAC (2)
ATGACAGAAG (2)
ATGGACTTTA
CCTTTTGGGT
TCAATTTATT
TCAGTTTATT (2)
TGAGGCCTTT
37.10.0371
P4.5 retinaACCAAAGAAA
ACCAATGAAC (2)
TCAATTTATT
TCAGTTTATT (2)
TGAGGCCTTT
TTAAAACAAA (3)
41.70.0417
P6.5 retinaACCAATGAAC (2)
ATGACAGAAG (2)
ATGGACTTTA
ATGTACAAGG (2)
TCAGTTTATT (2)
TGTCAAAGCA (2)
48.40.0484
P10.5 crx- retinaATGACAGAAG (2)
CCTTTTGGGT
TACTTTTGGA
TCAGTTTATT (2)
44.60.0446
P10.5 crx+ retinaACCAATGAAC (2)
ATGACAGAAG (2)
CCTTTTGGGT
GCTACACTCT
TACTTTTGGA
TCAGTTTATT (2)
TGTCAAAGCA (2)
TTAAAAAACA (2)
30.60.0306
Adult retinalACCAAAGAAA
ACCAATGAAC (2)
ATTTTTGTGT
CCTTTTGGGT
TACTTTTGGA
TCAGTTTATT (2)
61.30.0613
ONLAACTACAGCT (2)
ACCAATGAAC (2)
ATGACAGAAG (2)
ATTTTTGTGT
CCTTTGACTT (2)
TACTTTTGGA
TCAGTTTATT (2)
TTAAAACAAA (3)
42.10.0421