Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.22109 2610204L23RikRIKEN cDNA 2610204L23 gene 11  11 E1  67163 
 Mm.22109 D13Mgi22DNA Segment, Chr 13, Mouse Genome Informatics 22 13    97906 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 14 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 76 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAATTTCTAG (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TTTTTTAACA (2)
11.30.0113
Cb medulloblastomaGCTTTGTGTA (4)
TTTTTTAACA (2)
4.60.0046
P8 GC+1d cultureATACAATCTG (2)
CAGGTGATAC (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
GGAAGAAGAC (2)
TACACAGTAG (5)
TTTTTTAACA (2)
13.60.0136
P8 GC+SHH+1d cultureGAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TAGAGCTGGT (2)
TTTTTTAACA (2)
9.40.0094
3T3 fibroblastsGCTTTGTGTA (4)
3.50.0035
E15 cortexGAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
14.80.0148
P1 cortexGCTTTGTGTA (4)
4.50.0045
HypothalamusAAATTTCTAG (2)
ATACAATCTG (2)
TACACAGTAG (5)
TAGAGCTGGT (2)
90.009
E12.5 retinaAAATTTCTAG (2)
GAGGAGCTGA (3)
TTTTTTAACA (2)
7.60.0076
E14.5 retinaGAAGATTCTG (2)
GCTTTGTGTA (4)
GGAAGAAGAC (2)
TACACAGTAG (5)
TAGAGCTGGT (2)
12.60.0126
E16.5 retinaTACACAGTAG (5)
1.80.0018
E18.5 retinaAAATTTCTAG (2)
ATACAATCTG (2)
GAGGAGCTGA (3)
TTTTTTAACA (2)
7.20.0072
P0.5 retinaGCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TAGAGCTGGT (2)
TTTTTTAACA (2)
11.80.0118
P2.5 retinaGAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TAGAGCTGGT (2)
TTTTTTAACA (2)
12.40.0124
P4.5 retinaAGGCGGAACG (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TTTTTTAACA (2)
13.90.0139
P6.5 retinaAGGCGGAACG (2)
GCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TTTTTTAACA (2)
11.60.0116
P10.5 crx- retinaAAATTTCTAG (2)
AGGCGGAACG (2)
CAGGTGATAC (2)
GAAGATTCTG (2)
GCTTTGTGTA (4)
TAGAGCTGGT (2)
26.20.0262
P10.5 crx+ retinaAAATTTCTAG (2)
AGGCGGAACG (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TACACAGTAG (5)
TTTTTTAACA (2)
30.70.0307
Adult retinalAGGCGGAACG (2)
GAGGAGCTGA (3)
TACACAGTAG (5)
TTTTTTAACA (2)
150.015
ONLAGGCGGAACG (2)
GAGGAGCTGA (3)
GCTTTGTGTA (4)
TTTTTTAACA (2)
9.50.0095