Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.22233	Psmb2	proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 2	4	4 57.6 cM	26445
Mm.22233	E330021A06Rik	RIKEN cDNA E330021A06 gene	4		319523
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 38 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GCTATGGTGC (2) 17.9 0.0179 P8 Cb GC CCTTTAGTCC (27) 1.6 0.0016 P8 GC+1d culture CCTTTAGTCC (27) 10.3 0.0103 P8 GC+1d culture GCTATGGTGC (2) 4.6 0.0046 P8 GC+SHH+1d culture GCTATGGTGC (2) 4.7 0.0047 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAGTCC (27) 3.5 0.0035 3T3 fibroblasts GCTATGGTGC (2) 31.5 0.0315 E15 cortex CCTTTAGTCC (27) 9.9 0.0099 E15 cortex GCTATGGTGC (2) 9.9 0.0099 P1 cortex CCTTTAGTCC (27) 27.3 0.0273 Hypothalamus CCTTTAGTCC (27) 3.6 0.0036 Hypothalamus GCTATGGTGC (2) 3.6 0.0036 E12.5 retina CCTTTAGTCC (27) 5.6 0.0056 E12.5 retina GCTATGGTGC (2) 3.8 0.0038 E14.5 retina CCTTTAGTCC (27) 14.6 0.0146 E14.5 retina GCTATGGTGC (2) 3.6 0.0036 E16.5 retina CCTTTAGTCC (27) 5.4 0.0054 E16.5 retina GAGGGCCAGC (5) 1.8 0.0018 E18.5 retina GCTATGGTGC (2) 7.3 0.0073 E18.5 retina CCTTTAGTCC (27) 5.5 0.0055 P0.5 retina GCTATGGTGC (2) 9.8 0.0098 P0.5 retina CCTTTAGTCC (27) 7.9 0.0079 P0.5 retina GAGGGCCAGC (5) 2 0.002 P2.5 retina CCTTTAGTCC (27) 5.3 0.0053 P2.5 retina GCTATGGTGC (2) 5.3 0.0053 P4.5 retina GCTATGGTGC (2) 5.9 0.0059 P4.5 retina CCTTTAGTCC (27) 4 0.004 P6.5 retina GCTATGGTGC (2) 6.7 0.0067 P6.5 retina CCTTTAGTCC (27) 3.3 0.0033 P10.5 crx- retina GCTATGGTGC (2) 5.6 0.0056 P10.5 crx- retina CCTTTAGTCC (27) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina GCTATGGTGC (2) 11.5 0.0115 P10.5 crx+ retina CCTTTAGTCC (27) 5.8 0.0058 Adult retinal GCTATGGTGC (2) 11.1 0.0111 Adult retinal CCTTTAGTCC (27) 3.7 0.0037 ONL GCTATGGTGC (2) 9.6 0.0096 ONL CCTTTAGTCC (27) 7.7 0.0077 ONL GAGGGCCAGC (5) 1.9 0.0019