Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.223980 Farp1FERM, RhoGEF (Arhgef) and pleckstrin domain protein 1 (chondrocyte-derived) 14    223254 
 Mm.223980 1810013H02RikRIKEN cDNA 1810013H02 gene 14    69763 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
ATCCAGCACA (2)
CCCACAAGGA (2)
GCGCAGTCTT (2)
TGCCACCACA (4)
215.30.2153
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (2)
GCGCAGTCTT (2)
800.10.8001
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
ATCCAGCACA (2)
GCGCAGTCTT (2)
GTTCCTGGTT (2)
TACTAGCACT (2)
213.30.2133
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
ATCCAGCACA (2)
GCGCAGTCTT (2)
GTGGGGAAAG (2)
GTTCCTGGTT (2)
TGCCACCACA (4)
2940.294
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (2)
GGCCTATCTC (3)
TGCCACCACA (4)
38.50.0385
E15 cortexAAAAAAAAAA (2)
GAACACTCCC (5)
217.70.2177
P1 cortexAAAAAAAAAA (2)
ATCCAGCACA (2)
GTTCCTGGTT (2)
263.50.2635
HypothalamusAAAAAAAAAA (2)
ATCCAGCACA (2)
GTTCCTGGTT (2)
TGCCACCACA (4)
132.20.1322
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
AGGGGAGGGG (2)
ATCCAGCACA (2)
GCGCAGTCTT (2)
GTGGGGAAAG (2)
GTTCCTGGTT (2)
TAATAAAGGC (5)
TGCCACCACA (4)
159.80.1598
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGGGAGGGG (2)
ATCCAGCACA (2)
GCGCAGTCTT (2)
GTTCCTGGTT (2)
TAATAAAGGC (5)
TGCCACCACA (4)
118.30.1183
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
ATCCAGCACA (2)
TACTAGCACT (2)
50.70.0507
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
ATCCAGCACA (2)
GAACACTCCC (5)
381.90.3819
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
ATCCAGCACA (2)
CCCACAAGGA (2)
TGCCACCACA (4)
139.40.1394
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
AGGGGAGGGG (2)
ATCCAGCACA (2)
GCGCAGTCTT (2)
GGCCTATCTC (3)
GTTCCTGGTT (2)
TAATAAAGGC (5)
TGCCACCACA (4)
352.10.3521
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
ATCCAGCACA (2)
GTTCCTGGTT (2)
291.30.2913
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
GTTCCTGGTT (2)
TACTAGCACT (2)
TGCCACCACA (4)
280.20.2802
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
ATCCAGCACA (2)
GGCCTATCTC (3)
GTTCCTGGTT (2)
TGCCACCACA (4)
59.60.0596
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (2)
AGGGGAGGGG (2)
TGCCACCACA (4)
99.90.0999
Adult retinalAAAAAAAAAA (2)
AACCAGGACT (2)
GTGGGGAAAG (2)
TACTAGCACT (2)
TGCCACCACA (4)
70.50.0705
ONLAAAAAAAAAA (2)
GCGCAGTCTT (2)
GTGGGGAAAG (2)
GTTCCTGGTT (2)
TGCCACCACA (4)
112.90.1129