| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 6.5 | 0.0065 |
| Cb medulloblastoma | TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 11.5 | 0.0115 |
| P8 GC+1d culture | TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 5.7 | 0.0057 |
| P8 GC+SHH+1d culture | TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 7 | 0.007 |
| 3T3 fibroblasts | CCTGTTTGCC (4) CTCTGTGCTG (4)
| 17.5 | 0.0175 |
| E15 cortex | TTTGCTTGCA (3)
| 4.9 | 0.0049 |
| Hypothalamus | AAGGCTACAC (4) CTCTGTGCTG (4) TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 9 | 0.009 |
| E12.5 retina | TTTGCTTGCA (3)
| 3.8 | 0.0038 |
| E14.5 retina | TAAAATGGTT (3) TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 9 | 0.009 |
| E16.5 retina | CCTGTTTGCC (4) TTTGCTTGCA (3)
| 7.2 | 0.0072 |
| E18.5 retina | TTTGCTTGCA (3)
| 5.5 | 0.0055 |
| P0.5 retina | CTCTGTGCTG (4) TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 7.9 | 0.0079 |
| P2.5 retina | AAGGCTACAC (4) CTCTGTGCTG (4) TAAAATGGTT (3) TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 12.4 | 0.0124 |
| P4.5 retina | AAGGCTACAC (4) CTCTGTGCTG (4) TAAAATGGTT (3) TTTGCTTGCA (3)
| 11.9 | 0.0119 |
| P6.5 retina | CTCTGTGCTG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 10 | 0.01 |
| P10.5 crx- retina | CTCTGTGCTG (4) TAAAATGGTT (3) TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 13.1 | 0.0131 |
| P10.5 crx+ retina | AAGGCTACAC (4) CCTGTTTGCC (4) TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 13.4 | 0.0134 |
| Adult retinal | TTTATGGATG (4) TTTGCTTGCA (3)
| 3.8 | 0.0038 |
| ONL | AAGGCTACAC (4) TTTGCTTGCA (3)
| 3.8 | 0.0038 |