Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.234700	Ywhae	tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, epsilon polypeptide	11	11 44.17 cM	22627
Mm.234700	BB217526	expressed sequence BB217526	11		104708
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 294 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACAGGAAGGA ATCCTGTGCT CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGGCGATG (5) CAGGGTGATG (4) CAGGTGATGG (2) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTGCAAC CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) TGCCAGGGGT TTTGACAGTA (2) 156.4 0.1564 Cb medulloblastoma ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA CAGGGCGATG (5) CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CGTGTGCAAC CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA GGGTTTGGCT GTGCTGGTAA (2) TAGAGAACAG 119.9 0.1199 P8 GC+1d culture ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA ATCCTGTGCT CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGGCGATG (5) CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTTCAAC (2) CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA GGGTTTGGCT TGCCAGGGGT TTTGACAGTA (2) 207.7 0.2077 P8 GC+SHH+1d culture ACAGGAAGGA ATCCTGTGCT CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGGCGATG (5) CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTTCAAC (2) CTGAACACAT CTGGCTTCCA (2) CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA GGCCAACCTG GGGTTTGGCT GTGCTGGTAA (2) TTTGACAGTA (2) 201.5 0.2015 3T3 fibroblasts ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA ATCCTGTGCT CAGGGCGATG (5) CAGGGGGATG CAGGTGATGG (2) CCTCCATCCT (3) CGTGTGCAAC CTGAACACAT CTTTTCAGCA (5) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA GGCCAACCTG 255.7 0.2557 E15 cortex ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA CAAGCTGCCT (2) CCTCCATCCT (3) CGTGTGCAAC CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA TGCCAGGGGT 128.3 0.1283 P1 cortex ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA ATCCTGTGCT CACCACCACT CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CTGAACACAT CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA 145.2 0.1452 Hypothalamus ACAGGAAGGA CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGCTTCCA (2) CAGGGTGATG (4) CAGGTGATGG (2) CCTCCATCCT (3) CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) 117.6 0.1176 E12.5 retina ACGCTGTGCA CACCACCACT CAGGGGGATG CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CTGAACACAT CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA GGGTTTGGCT GTGCTGGTAA (2) 170.8 0.1708 E14.5 retina ACGCTGTGCA CACCACCACT CAGGCTTCCA (2) CAGGGGGATG CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA GGGTTTGGCT GTGCTGGTAA (2) 215 0.215 E16.5 retina ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA ATTACGCCAA CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTTCAAC (2) CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) TGCCAGGGGT 186.4 0.1864 E18.5 retina ACAGGAAGGA CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGCTTCCA (2) CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTGCAAC CTGAACACAT CTGGCTTCCA (2) CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) 203.7 0.2037 P0.5 retina ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA ATTACGCCAA CACCACCACT CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) TGCCAGGGGT 106.1 0.1061 P2.5 retina ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTGCAAC CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) 160.1 0.1601 P4.5 retina ACGCTGTGCA ATCCTGTGCT CACCACCACT CAGGCTTCCA (2) CAGGGGGATG CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA GGCCAACCTG 132.8 0.1328 P6.5 retina AACAGAAGGA (2) ACAGGAAGGA ATCCTGTGCT CACCACCACT CAGGGGGATG CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTGCAAC CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) 113.4 0.1134 P10.5 crx- retina AACAGAAGGA (2) ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA ATCCTGTGCT CACCACCACT CAGGGCGATG (5) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTGCAAC CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) TAGAGAACAG 126.6 0.1266 P10.5 crx+ retina ACAGGAAGGA ATCCTGTGCT CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGGCGATG (5) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTTCAAC (2) CTGAACACAT CTGGCTTCCA (2) CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GCAGCTCACA GTGCTGGTAA (2) TAGAGAACAG 130.5 0.1305 Adult retinal ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA ATCCTGTGCT ATTACGCCAA CAAGCTGCCT (2) CACCACCACT CAGGGTGATG (4) CCTCCATCCT (3) CCTTTATTCC (3) CGTGTGCAAC CTGAACACAT CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA 117 0.117 ONL ACAGGAAGGA ACGCTGTGCA CACCACCACT CAGGGTGATG (4) CCTTTATTCC (3) CTGTGTTTCA (2) CTTTTCAGCA (5) GAATTAACAT (2) GACTTTGGAA (2) GCAGCTCACA 91.9 0.0919