Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.24433	Sumo3	SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 3 (yeast)	10	10 41.6 cM	20610
Human Homolog	SUMO3[SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 3 (yeast)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 97 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTGTGGGAT CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA CCTTTGGGAT (2) GCCACTAGGA TCGGAAGAGA (2) TTGTGTAAGA 14.5 0.0145 Cb medulloblastoma CAGCCACACC CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA GGTGGGATGT (2) TCGGAAGAGA (2) 11.5 0.0115 P8 GC+1d culture CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA CTGCTGATGC (2) GCTGAAAACG (2) GGTGGGATGT (2) TTGTGTAAGA 17.1 0.0171 P8 GC+SHH+1d culture CCTTCTGCCT (4) GCCACTAGGA GGTGGGATGT (2) TTGTGTAAGA 9.4 0.0094 3T3 fibroblasts AGGGTGTGAA (2) CCTGTGGGAT CCTTCTGCCT (4) CTGCTGATGC (2) GCCACTAGGA TTGTGTAAGA 31.5 0.0315 E15 cortex CCTGTGGGAT CTGCTGATGC (2) 9.8 0.0098 P1 cortex CCTTCTGCCT (4) TTGTGTAAGA 18.1 0.0181 Hypothalamus CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA CCTTTGGGAT (2) CTGCTGATGC (2) TACCCAGTAC TTGTGTAAGA 16.2 0.0162 E12.5 retina CCTTCTGCCT (4) CCTTTGGGAT (2) GCCACTAGGA GGTGGGATGT (2) TTGTGTAAGA 18.9 0.0189 E14.5 retina CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA CTGCTGATGC (2) GCCACTAGGA GGTGGGATGT (2) TCGGAAGAGA (2) TTGTGTAAGA 18.1 0.0181 E16.5 retina CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA GCTGAAAACG (2) GGTGGGATGT (2) TCGGAAGAGA (2) TTGTGTAAGA 14.4 0.0144 E18.5 retina CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA CTGCTGATGC (2) GGTGGGATGT (2) TTGTGTAAGA 21.8 0.0218 P0.5 retina CCTTCTGCCT (4) CCTTTGGGAT (2) CTGCTGATGC (2) GCTGAAAACG (2) TTGTGTAAGA 25.6 0.0256 P2.5 retina CCTTCTGCCT (4) GCCACTAGGA GCTGAAAACG (2) TTGTGTAAGA 10.6 0.0106 P4.5 retina CTGCTGATGC (2) GGTGGGATGT (2) TTGTGTAAGA 10 0.01 P6.5 retina CAGCCACACC CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA CTGCTGATGC (2) GCCACTAGGA TACCCAGTAC TTGTGTAAGA 24.9 0.0249 P10.5 crx- retina CCTTCTGCCT (4) CTGCTGATGC (2) GGTGGGATGT (2) 7.5 0.0075 P10.5 crx+ retina CCTTCTGCCT (4) CTGCTGATGC (2) GCCACTAGGA GGTGGGATGT (2) TCGGAAGAGA (2) TTGTGTAAGA 13.3 0.0133 Adult retinal CAGCCACACC CCTGTGGGAT CCTTCTGCCT (4) CCTTGTGGGA CTGCTGATGC (2) GGTGGGATGT (2) TACCCAGTAC TTGTGTAAGA 17 0.017