Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.247951 Efhd1EF hand domain containing 1 1    98363 
 Gene Ontology calcium ion binding
 Human Homolog EFHD1[EF hand domain containing 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 31 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTTTTATTTAA (17)3.30.0033
P8 Cb GCCAAATGATCT1.60.0016
Cb medulloblastomaCAAATGATCT4.60.0046
Cb medulloblastomaATTTAAAAGA (8)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTTTATTTAA (17)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTTTTATTTAA (17)3.40.0034
P8 GC+1d cultureCCCTCCCTTT (5)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTTTTATTTAA (17)2.30.0023
P1 cortexTTTTATTTAA (17)9.10.0091
HypothalamusCAAATGATCT7.20.0072
HypothalamusTTTTATTTAA (17)1.80.0018
E12.5 retinaTTTTATTTAA (17)11.30.0113
E12.5 retinaCAAATGATCT3.80.0038
E12.5 retinaATTTAAAAGA (8)1.90.0019
E14.5 retinaTTTTATTTAA (17)3.60.0036
E14.5 retinaCCCTCCCTTT (5)1.80.0018
E16.5 retinaCAAATGATCT3.60.0036
E18.5 retinaCAAATGATCT3.60.0036
E18.5 retinaTTTTATTTAA (17)3.60.0036
P0.5 retinaTTTTATTTAA (17)20.002
P2.5 retinaCAAATGATCT3.50.0035
P2.5 retinaTTTTATTTAA (17)1.80.0018
P4.5 retinaTTTTATTTAA (17)13.90.0139
P4.5 retinaATTTAAAAGA (8)40.004
P4.5 retinaCAAATGATCT20.002
P4.5 retinaCCCTCCCTTT (5)20.002
P6.5 retinaTTTTATTTAA (17)6.70.0067
P6.5 retinaCAAATGATCT3.30.0033
P10.5 crx- retinaATTTAAAAGA (8)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTTTTATTTAA (17)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTTTTATTTAA (17)1.90.0019