Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.248769	D17Wsu94e	DNA segment, Chr 17, Wayne State University 94, expressed	17	17 24.0 cM	28064
Gene Ontology	integral to membrane
Human Homolog	C6orf109[chromosome 6 open reading frame 109]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 77 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCCCTCTTCC (2) GCTCTTCCTG GGTGAGCTGC (2) 11.4 0.0114 Cb medulloblastoma CCCCTCTTCC (2) GGTGCTGGGA (2) GGTGGGATGT (2) 6.9 0.0069 P8 GC+1d culture CAGAGGGTCC CCCCTCTTCC (2) CTGGATGGTT (2) GGTGGGATGT (2) 17.1 0.0171 P8 GC+SHH+1d culture CAGAGGGTCC CCCCTCTTCC (2) GGTGGGATGT (2) 21.1 0.0211 3T3 fibroblasts CAGAGGGTCC CCCCTCTTCC (2) CCCTCTTCTA GTGGAGCACA (2) 35 0.035 E15 cortex CCCCTCTTCC (2) GGTGAGCTGC (2) GGTGCTGGGA (2) 29.6 0.0296 P1 cortex GTGGAGCACA (2) 18.2 0.0182 Hypothalamus CCCCTCTTCC (2) CTCTTCCTGT (2) GGTGCTGGGA (2) 12.6 0.0126 E12.5 retina CCCCTCTTCC (2) GGTGCTGGGA (2) GGTGGGATGT (2) 7.6 0.0076 E14.5 retina CCCCTCTTCC (2) CTCTTCCTGT (2) GGTGCTGGGA (2) GGTGGGATGT (2) 12.7 0.0127 E16.5 retina CCCCTCTTCC (2) GGTGGGATGT (2) 5.4 0.0054 E18.5 retina CCCCTCTTCC (2) GGTGGGATGT (2) 14.5 0.0145 P0.5 retina CAGAGGGTCC CCCCTCTTCC (2) CCCTCTTCTA CTCTTCCTGT (2) GGTGCTGGGA (2) GTGGAGCACA (2) 27.4 0.0274 P2.5 retina CAGAGGGTCC CCCCTCTTCC (2) CTCTTCCTGT (2) GGTGCTGGGA (2) 15.9 0.0159 P4.5 retina CCCCTCTTCC (2) CTCTTCCTGT (2) GGTGGGATGT (2) 13.9 0.0139 P6.5 retina CAGAGGGTCC CCCCTCTTCC (2) CTCTTCCTGT (2) GCTCTTCCTG GGTGCTGGGA (2) GTGGAGCACA (2) 21.6 0.0216 P10.5 crx- retina CAGAGGGTCC CCCCTCTTCC (2) CTCTTCCTGT (2) GGTGGGATGT (2) 13 0.013 P10.5 crx+ retina CAGAGGGTCC CCCTCTTCTA CTGGATGGTT (2) GGTGCTGGGA (2) GGTGGGATGT (2) GTGGAGCACA (2) 13.3 0.0133 Adult retinal CAGAGGGTCC CCCTCTTCTA CTCTTCCTGT (2) CTGGATGGTT (2) GGTGCTGGGA (2) GGTGGGATGT (2) GTGGAGCACA (2) 20.6 0.0206 ONL CCCCTCTTCC (2) CCCTCTTCTA GCTCTTCCTG GGTGAGCTGC (2) GGTGCTGGGA (2) GTGGAGCACA (2) 15.2 0.0152