Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.248827 AI316784expressed sequence AI316784 11    103672 
 Mm.248827 Canxcalnexin 11  11 30.0 cM  12330 
 Gene Ontology calcium ion binding | calcium ion storage activity | endoplasmic reticulum | extracellular space | integral to membrane | integral to membrane | protein folding | sugar binding
 Human Homolog CANX[calnexin]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 103 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGCAACTAA (2)
CTGTGTGTCA (3)
GACATTTTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TGTCTGTCCT (4)
42.40.0424
Cb medulloblastomaCTGTGTGTCA (3)
TAACAGTTGT (2)
TGTCTGTCCT (4)
370.037
P8 GC+1d cultureAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
CCAGTAGTAC (2)
CTGTGTGTCA (3)
GACATTTTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTCTTCTTT (6)
TTTTTTTCCC (3)
53.50.0535
P8 GC+SHH+1d cultureAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
CCAGTAGTAC (2)
CTGTGTGTCA (3)
GACATTTTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTCTTCTTT (6)
67.70.0677
3T3 fibroblastsAAGCAACTAA (2)
CTGTGTGTCA (3)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
490.049
P1 cortexAACAAATGAA (2)
TAACAGTTGT (2)
13.60.0136
HypothalamusAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
TAACAGTTGT (2)
TTTCTTCTTT (6)
32.60.0326
E12.5 retinaAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
GACATTTTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTCTTCTTT (6)
TTTTTTTCCC (3)
90.20.0902
E14.5 retinaAACAAATGAA (2)
CTGTGTGTCA (3)
GACATTTTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTTTTTCCC (3)
25.40.0254
E16.5 retinaGACATTTTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTCTTCTTT (6)
32.50.0325
E18.5 retinaAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
TAACAGTTGT (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTTTTTCCC (3)
56.30.0563
P0.5 retinaAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
CCAGTAGTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TTTTTTTCCC (3)
45.20.0452
P2.5 retinaAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
CTAAGAGGCC (2)
GACATTTTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
49.40.0494
P4.5 retinaAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
41.70.0417
P6.5 retinaAAGCAACTAA (2)
CTAAGAGGCC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TTTTTTTCCC (3)
26.70.0267
P10.5 crx- retinaAACAAATGAA (2)
CCAGTAGTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTTTTTCCC (3)
72.50.0725
P10.5 crx+ retinaAAGCAACTAA (2)
CTGTGTGTCA (3)
TAACAGTTGT (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTTTTTCCC (3)
480.048
Adult retinalGACATTTTAC (2)
TAACAGTTGT (2)
TGGAATGCAG (2)
TGTCTGTCCT (4)
29.70.0297
ONLAACAAATGAA (2)
AAGCAACTAA (2)
TAACAGTTGT (2)
TGTCTGTCCT (4)
TTTTTTTCCC (3)
38.30.0383