Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.249560 C2taclass II transactivator 16    12265 
 Gene Ontology ATP binding | nucleus | regulation of transcription | regulation of transcription, DNA-dependent | transcription regulator activity
 Human Homolog MHC2TA[MHC class II transactivator]

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 29 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTTGGACTCA (2)1.60.0016
P8 Cb GCGCTGCTGGGG (6)1.60.0016
Cb medulloblastomaCTTGGACTCA (2)4.60.0046
P8 GC+1d cultureCTTGGACTCA (2)4.60.0046
P8 GC+1d cultureAGCCTGATGG (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGTAGAAGGAG (12)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCTTGGACTCA (2)1.20.0012
E15 cortexAGCCTGATGG (4)9.90.0099
P1 cortexCTTGGACTCA (2)4.50.0045
HypothalamusCTTGGACTCA (2)5.40.0054
E12.5 retinaCTTGGACTCA (2)1.90.0019
E12.5 retinaGCTGCTGGGG (6)1.90.0019
E14.5 retinaAGCCTGATGG (4)1.80.0018
E14.5 retinaCTTGGACTCA (2)1.80.0018
E16.5 retinaGTAGAAGGAG (12)1.80.0018
E18.5 retinaCTTGGACTCA (2)5.50.0055
P0.5 retinaGCTGCTGGGG (6)3.90.0039
P2.5 retinaGTAGAAGGAG (12)3.50.0035
P2.5 retinaGCTGCTGGGG (6)1.80.0018
P4.5 retinaCTTGGACTCA (2)40.004
P6.5 retinaCTTGGACTCA (2)1.70.0017
P6.5 retinaGCTGCTGGGG (6)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCTTGGACTCA (2)5.60.0056
P10.5 crx- retinaAGCCTGATGG (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCTTGGACTCA (2)3.80.0038
Adult retinalGCTGCTGGGG (6)11.10.0111
Adult retinalAGCCTGATGG (4)1.90.0019
ONLCTTGGACTCA (2)1.90.0019
ONLGCTGCTGGGG (6)1.90.0019