Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.25059 D13Ertd787eDNA segment, Chr 13, ERATO Doi 787, expressed 13  13 29.0 cM  52680 
 Mm.25059 D13Ertd42eDNA segment, Chr 13, ERATO Doi 42, expressed 13  13 29.0 cM  52475 
 Mm.25059 AU018574expressed sequence AU018574 13    105273 
 Mm.25059 A930104B17RikRIKEN cDNA A930104B17 gene 13    319835 
 Mm.25059 Jarid2jumonji, AT rich interactive domain 2 13  13 27.0 cM  16468 
 Gene Ontology development | DNA binding | intracellular | nucleus
 Human Homolog JARID2[Jumonji, AT rich interactive domain 2]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 80 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGAGAAAAA (6)
GCTGTGAAAT (6)
TATAAGTGCT (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
19.70.0197
Cb medulloblastomaAAGAGAAAAA (6)
GATGACAGGG (5)
TATAAGTGCT (5)
TTTTAACAAA (6)
16.10.0161
P8 GC+1d cultureAAGAGAAAAA (6)
GATGACAGGG (5)
GCTGAGAAAT (6)
GCTGTGAAAT (6)
TATAAGTGCT (5)
TATAAGTGTA (5)
TATAAGTGTT (6)
TCACAAGAGA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
27.30.0273
P8 GC+SHH+1d cultureAAGAGAAAAA (6)
AATTTAAAGC (7)
GATGACAGGG (5)
GCAAGACAGA (5)
GCGATGGAGA (5)
GCTGAGAAAT (6)
TATAAGTGCT (5)
TCACAAGAGA (5)
TTTTAACAAA (6)
23.50.0235
P1 cortexGCTGTGAAAT (6)
TTTTAACAAA (6)
18.10.0181
HypothalamusTATAAGTGTA (5)
TATAAGTGTT (6)
TTTTAACAAA (6)
5.40.0054
E12.5 retinaGCGATGGAGA (5)
TATAAGTGTA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
13.20.0132
E14.5 retinaTATAAGTGTA (5)
TCACAAGAGA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
10.90.0109
E16.5 retinaAAGAGAAAAA (6)
GCTGTGAAAT (6)
TTTTAACAAA (6)
14.50.0145
E18.5 retinaAAGAGAAAAA (6)
TATAAGTGTA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
10.90.0109
P0.5 retinaAATTTAAAGC (7)
GCGATGGAGA (5)
GCTGTGAAAT (6)
TATAAGTGCT (5)
TATAAGTGTA (5)
TGCGAAGGGA (5)
TTTTAACAAA (6)
15.90.0159
P2.5 retinaTATAAGTGCT (5)
TTTTAACAAA (6)
7.10.0071
P4.5 retinaAAGAGAAAAA (6)
GCTGTGAAAT (6)
TATAAGTGTT (6)
TTTTAACAAA (6)
80.008
P6.5 retinaGATGACAGGG (5)
GCTGTGAAAT (6)
TATAAGTGCT (5)
TATAAGTGTA (5)
TTTTAACAAA (6)
10.10.0101
P10.5 crx- retinaAAGAGAAAAA (6)
TATAAGTGCT (5)
TTTTAACAAA (6)
7.50.0075
P10.5 crx+ retinaGATGACAGGG (5)
GCAAGACAGA (5)
GCTGTGAAAT (6)
TTTTAACAAA (6)
13.40.0134
Adult retinalGCGATGGAGA (5)
TATAAGTGCT (5)
7.50.0075
ONLAATTTAAAGC (7)
GATGACAGGG (5)
GCTGAGAAAT (6)
TATAAGTGTT (6)
TTTTAACAAA (6)
11.40.0114