Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.257276 1110004P21RikRIKEN cDNA 1110004P21 gene 4    68478 
 Mm.257276 Sfpqsplicing factor proline/glutamine rich (polypyrimidine tract binding protein associated) 4  4 57.6 cM  71514 
 Gene Ontology biological_process unknown | cellular_component unknown | nucleic acid binding
 Human Homolog SFPQ[splicing factor proline/glutamine rich (polypyrimidine tract binding protein associated)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 195 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAACAAAAA (4)
AATAGCAAAG (2)
ATTCCGAATT (2)
CGTACTGAGC (2)
GACATCAACT (3)
GAGGAACTTC (2)
GATGGGAAAG (3)
GCAAATCCAA (2)
GCACATTTGA (2)
GGACAAGAGA
GGTCAGCTAA (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
283.90.2839
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAACAAAAA (4)
GATGGGAAAG (3)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTATTTTCAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
827.70.8277
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAACAAAAA (4)
AATAGCAAAG (2)
CACTGGAGGT (2)
CGTACTGAGC (2)
GACATCAACT (3)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
244.10.2441
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAACAAAAA (4)
AATAGCAAAG (2)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GACATCAACT (3)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TAGCCCATCC (2)
TATTAAGATT (2)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
324.30.3243
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (2)
AATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GAACCACTCA (2)
TTGTGTGCTG (2)
630.063
E15 cortexAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAAGAGGAA (3)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GAGGAACTTC (2)
GATGGGAAAG (3)
GCACATTTGA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
306.50.3065
P1 cortexAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAAGAGGAA (3)
CGTACTGAGC (2)
GATGGGAAAG (3)
GCACATTTGA (2)
TTGTGTGCTG (2)
331.60.3316
HypothalamusAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAACAAAAA (4)
GGTCAGCTAA (2)
TTATTTTCAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
141.20.1412
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GCACATTTGA (2)
GGACAAGAGA
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
170.90.1709
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
CGTACTGAGC (2)
GAACCACTCA (2)
GAGGAACTTC (2)
GCAAATCCAA (2)
GGACAAGAGA
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TAGCCCATCC (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
136.30.1363
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AATAGCAAAG (2)
GCAAATCCAA (2)
GGAGATCCCT (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
850.085
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AATAGCAAAG (2)
CACTGGAGGT (2)
CCCATTCAAA (2)
GGAGATCCCT (2)
GGTCAGCTAA (2)
TATTAAGATT (2)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
418.30.4183
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAGAGGAA (3)
AATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TTGTGTGCTG (2)
168.90.1689
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GATGGGAAAG (3)
GGTCAGCTAA (2)
TATTAAGATT (2)
TTGTGTGCTG (2)
3890.389
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAAGAGGAA (3)
AATAGCAAAG (2)
ATTCCGAATT (2)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GACATCAACT (3)
GCAAATCCAA (2)
GGACAAGAGA
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TAGCCCATCC (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
3450.345
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAACAAAAA (4)
AATAGCAAAG (2)
ATTCCGAATT (2)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GATGGGAAAG (3)
GCAAATCCAA (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
TTTAACAATC (2)
3220.322
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (2)
AAAAAAAAAC (2)
AAAACAAAAA (4)
AATAGCAAAG (2)
GAGGAACTTC (2)
GCAAATCCAA (2)
GGACAAGAGA
GGAGATCCCT (2)
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TTGTGTGCTG (2)
80.20.0802
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (2)
AATAGCAAAG (2)
CCCATTCAAA (2)
CGTACTGAGC (2)
GATGGGAAAG (3)
GCAAATCCAA (2)
GGACAAGAGA
GGTCAGCTAA (2)
GTGGTATTAG (2)
TTGTGTGCTG (2)
130.60.1306
Adult retinalAAAAAAAAAA (2)
AAAACAAAAA (4)
AAAAGAGGAA (3)
AATAGCAAAG (2)
CGTACTGAGC (2)
GGTCAGCTAA (2)
TTGTGTGCTG (2)
87.20.0872
ONLAAAAAAAAAA (2)
AAAACAAAAA (4)
AAAAGAGGAA (3)
AATAGCAAAG (2)
ATTCCGAATT (2)
GAGGAACTTC (2)
GGTCAGCTAA (2)
TATTAAGATT (2)
TTCCTGAATT (3)
TTGTGTGCTG (2)
130.10.1301