Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.259035 D030028O16RikRIKEN cDNA D030028O16 gene 17    213760 
 Human Homolog KIAA0436[putative prolyl oligopeptidase]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 115 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAAAAAAAAA (157)47.30.0473
P8 Cb GCCCACAGAGCT (6)22.80.0228
P8 Cb GCCACACACACA (106)11.40.0114
P8 Cb GCTGTTTGTTCT (9)4.90.0049
P8 Cb GCAATGGCATCA (6)1.60.0016
P8 Cb GCGAGTAGACTC (4)1.60.0016
P8 Cb GCGGAAAATAAA (15)1.60.0016
Cb medulloblastomaCAAAAAAAAA (157)92.50.0925
Cb medulloblastomaCACACACACA (106)32.40.0324
Cb medulloblastomaCCACAGAGCT (6)9.20.0092
Cb medulloblastomaAATGGCATCA (6)2.30.0023
Cb medulloblastomaCAAAGAAAAA (11)2.30.0023
Cb medulloblastomaCAGAAACAGA (8)2.30.0023
Cb medulloblastomaGAGTAGACTC (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCACAGAGCT (6)43.40.0434
P8 GC+1d cultureCAAAAAAAAA (157)37.70.0377
P8 GC+1d cultureCACACACACA (106)6.80.0068
P8 GC+1d cultureGAAATAATAA (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGTTTGTTCT (9)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCAAAAAAAAA (157)58.50.0585
P8 GC+SHH+1d cultureCCACAGAGCT (6)19.90.0199
P8 GC+SHH+1d cultureCACACACACA (106)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureAATGGCATCA (6)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCAAAGAAAAA (11)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGAAATAATAA (4)1.20.0012
3T3 fibroblastsCACACACACA (106)17.50.0175
3T3 fibroblastsCCACAGAGCT (6)10.50.0105
3T3 fibroblastsAATGGCATCA (6)70.007
E15 cortexCCACAGAGCT (6)39.60.0396
E15 cortexCAAAAAAAAA (157)34.60.0346
E15 cortexCACACACACA (106)4.90.0049
E15 cortexCAGAAACAGA (8)4.90.0049
P1 cortexCACACACACA (106)27.30.0273
P1 cortexCAAAAAAAAA (157)22.70.0227
P1 cortexCCACAGAGCT (6)18.20.0182
P1 cortexTGTTTGTTCT (9)4.50.0045
HypothalamusCACACACACA (106)960.096
HypothalamusCAAAAAAAAA (157)39.80.0398
HypothalamusCCACAGAGCT (6)16.30.0163
HypothalamusGGGGGTTGGG (5)7.20.0072
HypothalamusCAAAGAAAAA (11)1.80.0018
HypothalamusGAAATAATAA (4)1.80.0018
HypothalamusGAGTAGACTC (4)1.80.0018
HypothalamusGGAAAATAAA (15)1.80.0018
E12.5 retinaCAAAAAAAAA (157)22.50.0225
E12.5 retinaCCACAGAGCT (6)16.90.0169
E12.5 retinaCACACACACA (106)3.80.0038
E12.5 retinaCCACAAAGCT (7)3.80.0038
E12.5 retinaCAAAGAAAAA (11)1.90.0019
E14.5 retinaCCACAGAGCT (6)310.031
E14.5 retinaCACACACACA (106)18.20.0182
E14.5 retinaCAAAAAAAAA (157)9.10.0091
E14.5 retinaAATGGCATCA (6)1.80.0018
E14.5 retinaCAAAGAAAAA (11)1.80.0018
E14.5 retinaTGTTTGTTCT (9)1.80.0018
E16.5 retinaCCACAGAGCT (6)50.70.0507
E16.5 retinaCACACACACA (106)12.70.0127
E16.5 retinaCAAAAAAAAA (157)9.10.0091
E16.5 retinaCAAAGAAAAA (11)1.80.0018
E16.5 retinaCCACAAAGCT (7)1.80.0018
E16.5 retinaGAAATAATAA (4)1.80.0018
E16.5 retinaGAGTAGACTC (4)1.80.0018
E18.5 retinaCAAAAAAAAA (157)41.80.0418
E18.5 retinaCCACAGAGCT (6)27.30.0273
E18.5 retinaCACACACACA (106)5.50.0055
E18.5 retinaCAAAGAAAAA (11)3.60.0036
E18.5 retinaTGTTTGTTCT (9)1.80.0018
P0.5 retinaCAAAAAAAAA (157)137.40.1374
P0.5 retinaCCACAGAGCT (6)29.40.0294
P0.5 retinaCAAAGAAAAA (11)7.90.0079
P0.5 retinaCACACACACA (106)7.90.0079
P0.5 retinaGAGTAGACTC (4)20.002
P2.5 retinaCAAAAAAAAA (157)52.80.0528
P2.5 retinaCCACAGAGCT (6)22.90.0229
P2.5 retinaCACACACACA (106)21.10.0211
P2.5 retinaCAAAGAAAAA (11)5.30.0053
P2.5 retinaCTGTTGGCTG (2)3.50.0035
P2.5 retinaGAAATAATAA (4)1.80.0018
P2.5 retinaGGAAAATAAA (15)1.80.0018
P4.5 retinaCAAAAAAAAA (157)41.60.0416
P4.5 retinaCCACAGAGCT (6)23.80.0238
P4.5 retinaCACACACACA (106)7.90.0079
P4.5 retinaGAAATAATAA (4)40.004
P4.5 retinaTGTTTGTTCT (9)40.004
P4.5 retinaCAGAAACAGA (8)20.002
P6.5 retinaCAAAAAAAAA (157)31.70.0317
P6.5 retinaCCACAGAGCT (6)28.30.0283
P6.5 retinaCACACACACA (106)8.30.0083
P6.5 retinaCAAAGAAAAA (11)1.70.0017
P6.5 retinaCAGAAACAGA (8)1.70.0017
P6.5 retinaTGTTTGTTCT (9)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCCACAGAGCT (6)61.30.0613
P10.5 crx- retinaCAAAAAAAAA (157)130.013
P10.5 crx- retinaCACACACACA (106)5.60.0056
P10.5 crx- retinaCAGAAACAGA (8)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGAAATAATAA (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGAGTAGACTC (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGTTTGTTCT (9)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCAAAAAAAAA (157)32.70.0327
P10.5 crx+ retinaCCACAGAGCT (6)15.40.0154
P10.5 crx+ retinaCACACACACA (106)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaGAAATAATAA (4)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTGTTTGTTCT (9)1.90.0019
Adult retinalCAAAAAAAAA (157)20.40.0204
Adult retinalCACACACACA (106)16.70.0167
Adult retinalCCACAGAGCT (6)14.80.0148
Adult retinalTGTTTGTTCT (9)3.70.0037
Adult retinalCAAAGAAAAA (11)1.90.0019
ONLCACACACACA (106)21.10.0211
ONLCAAAAAAAAA (157)17.20.0172
ONLGGGGGTTGGG (5)15.30.0153
ONLCCACAGAGCT (6)7.70.0077
ONLAATGGCATCA (6)1.90.0019
ONLCTGTTGGCTG (2)1.90.0019
ONLGAAATAATAA (4)1.90.0019