Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.260042	1500032L24Rik	RIKEN cDNA 1500032L24 gene	15		69029
Gene Ontology	extracellular space | integral to membrane
Human Homolog	LOC91689[hypothetical gene supported by AL449243]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 64 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC TATGATGAAA (2) 17.9 0.0179 P8 Cb GC TATGAAAAAA (6) 3.3 0.0033 P8 Cb GC TTCAGATCCC (4) 1.6 0.0016 Cb medulloblastoma TATGATGAAA (2) 20.8 0.0208 Cb medulloblastoma TATGAAAAAA (6) 9.2 0.0092 Cb medulloblastoma TATGATGAGA (2) 4.6 0.0046 Cb medulloblastoma AAAAAAAACA (13) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture TATGATGAAA (2) 20.5 0.0205 P8 GC+1d culture TATGAAAAAA (6) 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture GTTTGTGACA 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture TATGATGAGA (2) 1.1 0.0011 P8 GC+SHH+1d culture TATGATGAAA (2) 19.9 0.0199 P8 GC+SHH+1d culture TATGAAAAAA (6) 3.5 0.0035 P1 cortex TATGATGAAA (2) 4.5 0.0045 Hypothalamus TATGATGAAA (2) 29 0.029 Hypothalamus TATGAAAAAA (6) 12.7 0.0127 Hypothalamus TATGATGAGA (2) 7.2 0.0072 Hypothalamus GTTTGTGACA 1.8 0.0018 E12.5 retina TATGATGAAA (2) 18.8 0.0188 E12.5 retina TATGAAAAAA (6) 3.8 0.0038 E12.5 retina TATGATGAGA (2) 3.8 0.0038 E14.5 retina TATGATGAAA (2) 25.5 0.0255 E14.5 retina TATGAAAAAA (6) 5.5 0.0055 E14.5 retina CCACCACATC 3.6 0.0036 E14.5 retina TATGATGAGA (2) 3.6 0.0036 E16.5 retina TATGATGAAA (2) 10.9 0.0109 E16.5 retina CCACCACATC 3.6 0.0036 E16.5 retina AAAAAAAACA (13) 1.8 0.0018 E16.5 retina ACATTTTTGT (4) 1.8 0.0018 E16.5 retina TATGAAAAAA (6) 1.8 0.0018 E16.5 retina TATGATGAGA (2) 1.8 0.0018 E18.5 retina TATGATGAAA (2) 27.3 0.0273 E18.5 retina TATGAAAAAA (6) 10.9 0.0109 E18.5 retina TATGATGAGA (2) 3.6 0.0036 E18.5 retina AAAAAAAACA (13) 1.8 0.0018 P0.5 retina TATGATGAAA (2) 11.8 0.0118 P0.5 retina TATGAAAAAA (6) 3.9 0.0039 P0.5 retina TATGATGAGA (2) 2 0.002 P0.5 retina TTCAGATCCC (4) 2 0.002 P2.5 retina TATGATGAAA (2) 24.6 0.0246 P2.5 retina TATGAAAAAA (6) 7 0.007 P4.5 retina TATGATGAAA (2) 31.7 0.0317 P4.5 retina TATGAAAAAA (6) 5.9 0.0059 P4.5 retina AAAAAAAACA (13) 2 0.002 P4.5 retina ACATTTTTGT (4) 2 0.002 P6.5 retina TATGATGAAA (2) 33.3 0.0333 P6.5 retina TATGAAAAAA (6) 6.7 0.0067 P6.5 retina TATGATGAGA (2) 1.7 0.0017 P10.5 crx- retina TATGATGAAA (2) 5.6 0.0056 P10.5 crx- retina CCACCACATC 1.9 0.0019 P10.5 crx- retina GTTTGTGACA 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TATGATGAAA (2) 17.3 0.0173 P10.5 crx+ retina TATGAAAAAA (6) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina AAAAAAAACA (13) 1.9 0.0019 Adult retinal TATGATGAAA (2) 11.1 0.0111 Adult retinal TATGAAAAAA (6) 3.7 0.0037 Adult retinal TTCAGATCCC (4) 3.7 0.0037 Adult retinal ACATTTTTGT (4) 1.9 0.0019 Adult retinal CCACCACATC 1.9 0.0019 Adult retinal TATGATGAGA (2) 1.9 0.0019 ONL TATGAAAAAA (6) 9.6 0.0096 ONL TATGATGAAA (2) 7.7 0.0077 ONL AAAAAAAACA (13) 1.9 0.0019 ONL TATGATGAGA (2) 1.9 0.0019