Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.260288 Ppp2caprotein phosphatase 2a, catalytic subunit, alpha isoform 11    19052 
 Mm.260288 R75353expressed sequence R75353 11    97777 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 70 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACCGGAACGT (2)
ACTGGAGATG (2)
ACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
AGGGTCCAAT (2)
CTGAGTAAGC (4)
TCACTCGTCG (2)
260.026
Cb medulloblastomaACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
AGGGTCCAAT (2)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
CTGACGCGAC (2)
CTGAGTAAGC (4)
TTTTCAGGTA (2)
19.30.0193
P8 GC+SHH+1d cultureACTGGAGATG (2)
ACTGTAGATG (2)
ACTTTTCATC (2)
AGGATGCTTG (2)
CTGACGCGAC (2)
23.50.0235
3T3 fibroblastsACTGTAGATG (2)
3.50.0035
E15 cortexACATTAGATG (4)
ACTGTAGATG (2)
9.80.0098
P1 cortexACTGTAGATG (2)
ACTTTTCATC (2)
AGGATGCTTG (2)
36.30.0363
HypothalamusACATTAGATG (4)
ACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
TCACTCGTCG (2)
TTTGCCCAGA (3)
12.60.0126
E12.5 retinaACTGGAGATG (2)
ACTGTAGATG (2)
ACTTTTCATC (2)
AGGATGCTTG (2)
170.017
E14.5 retinaACATTAGATG (4)
ACCGGAACGT (2)
ACTGTAGATG (2)
ACTTTTCATC (2)
AGGATGCTTG (2)
CTGAGTAAGC (4)
18.10.0181
E16.5 retinaACATTAGATG (4)
ACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
16.30.0163
E18.5 retinaACTGGAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
3.60.0036
P0.5 retinaACCGGAACGT (2)
ACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
17.70.0177
P2.5 retinaACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
140.014
P4.5 retinaAGGATGCTTG (2)
CTGACGCGAC (2)
9.90.0099
P6.5 retinaACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
TTTGCCCAGA (3)
16.70.0167
P10.5 crx- retinaACTGGAGATG (2)
ACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
CTGAGTAAGC (4)
TTTTCAGGTA (2)
35.30.0353
P10.5 crx+ retinaACCGGAACGT (2)
ACTGTAGATG (2)
ACTTTTCATC (2)
AGGATGCTTG (2)
TTTGCCCAGA (3)
24.90.0249
Adult retinalACTGTAGATG (2)
AGGATGCTTG (2)
18.50.0185
ONLACTGTAGATG (2)
CTGAGTAAGC (4)
7.60.0076