Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.261750 B430306D02RikRIKEN cDNA B430306D02 gene X  X 38.0 cM  270627 
 Gene Ontology transcription factor TFIID complex
 Human Homolog TAF1[TAF1 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 250kDa]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 66 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATGCTCTGGG (2)
CCTTTAATCC (3)
GAATCTCTCC
TAAATGTCCT
70.20.0702
Cb medulloblastomaAGCATCAATA
ATGCTCTGGG (2)
CCTTTAATCC (3)
94.70.0947
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (3)
GAATCTCTCC
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
45.70.0457
P8 GC+SHH+1d cultureAGCATCAATA
CCTTTAATCC (3)
GAATCTCTCC
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
43.30.0433
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (3)
70.10.0701
E15 cortexCCTTTAATCC (3)
TATGATTCAG (2)
59.30.0593
P1 cortexCCTTTAATCC (3)
154.50.1545
HypothalamusAGCATCAATA
ATGCTCTGGG (2)
CCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
43.40.0434
E12.5 retinaCCTTTAATCC (3)
GAATCTCTCC
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
95.80.0958
E14.5 retinaATGCTCTGGG (2)
CCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
127.50.1275
E16.5 retinaCCTTTAATCC (3)
GAATCTCTCC
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
86.90.0869
E18.5 retinaCCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
32.70.0327
P0.5 retinaATGCTCTGGG (2)
CCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
90.20.0902
P2.5 retinaCCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
880.088
P4.5 retinaCCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
49.60.0496
P6.5 retinaCCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
88.30.0883
P10.5 crx- retinaATGCTCTGGG (2)
CCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
74.40.0744
P10.5 crx+ retinaATGCTCTGGG (2)
CCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
TATGATTCAG (2)
51.80.0518
Adult retinalAGCATCAATA
ATGCTCTGGG (2)
CCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
137.10.1371
ONLCCTTTAATCC (3)
TAAATGTCCT
97.70.0977