Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.262000 Ptp4a1protein tyrosine phosphatase 4a1 1  1 B  19243 
 Gene Ontology protein-tyrosine-phosphatase activity
 Human Homolog PTP4A1[protein tyrosine phosphatase type IVA, member 1]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 15 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 77 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAATGCTGTG (2)
AATTAAAAAT (4)
AATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTGTATTCCT
TAGAGTATGC (3)
37.50.0375
Cb medulloblastomaAATTAAAAAT (4)
ATGGCTTAAT
11.50.0115
P8 GC+1d cultureAAATGCTGTG (2)
AATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTGTATTCCT
TAGAGTATGC (3)
TGCCAAATAC
22.90.0229
P8 GC+SHH+1d cultureAAATGCTGTG (2)
AATTAAAAAT (4)
AATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTCGTCTGGT
GTGTATTCCT
TAGAGTATGC (3)
TGCCAAATAC
35.20.0352
3T3 fibroblastsGTCATAGCTG (2)
10.50.0105
E15 cortexAATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
TGCCAAATAC
24.60.0246
P1 cortexATGGCTTAAT
9.10.0091
HypothalamusATGGCTTAAT
GTGTATTCCT
TAATGAACTT (2)
TGCCAAATAC
18.10.0181
E12.5 retinaAATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTGTATTCCT
TAGAGTATGC (3)
30.10.0301
E14.5 retinaATGGCTTAAT
TAATGAACTT (2)
TAGAGTATGC (3)
14.50.0145
E16.5 retinaAATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTGTATTCCT
TAATGAACTT (2)
23.50.0235
E18.5 retinaAATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
TAGAGTATGC (3)
TGCCAAATAC
32.70.0327
P0.5 retinaATGGCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
GTCGTCTGGT
TAGAGTATGC (3)
21.60.0216
P2.5 retinaAAATGCTGTG (2)
AATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
GTGTATTCCT
TAATGAACTT (2)
TGCCAAATAC
530.053
P4.5 retinaAAATGCTGTG (2)
AATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
GTGTATTCCT
27.80.0278
P6.5 retinaAATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
21.60.0216
P10.5 crx- retinaAAATGCTGTG (2)
ATGGCTTAAT
9.30.0093
P10.5 crx+ retinaAATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
5.70.0057
Adult retinalAATTGGAAAT
ATGGCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
TAGAGTATGC (3)
7.60.0076
ONLATGGCTTAAT
GTCATAGCTG (2)
GTGTATTCCT
13.30.0133