Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.263396 4633401G24RikRIKEN cDNA 4633401G24 gene 8    70812 
 Mm.263396 Itgb1integrin beta 1 (fibronectin receptor beta) 8    16412 
 Gene Ontology cell adhesion | cell-matrix adhesion | extracellular space | G1/S transition of mitotic cell cycle | integral to membrane | integrin complex | integrin-mediated signaling pathway | metabolism | oxidoreductase activity | plasma membrane | protein binding | receptor activity | regulation of cell cycle | synaptosome
 Human Homolog ITGB1[integrin, beta 1 (fibronectin receptor, beta polypeptide, antigen CD29 includes MDF2, MSK12)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 72 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGACTGTTCT (2)
24.40.0244
Cb medulloblastomaACTGATTTTC (4)
TCAGACCTGC (3)
4.60.0046
P8 GC+1d cultureACTGATTTTC (4)
CAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
TGACTGTTCT (2)
TGCAGGTGCA (2)
55.90.0559
P8 GC+SHH+1d cultureACTGATTTTC (4)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGACTGTTCT (2)
TGCAGGTGCA (2)
65.50.0655
3T3 fibroblastsCAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
84.10.0841
E15 cortexAGCAAATCAA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
29.60.0296
P1 cortexCAGGTTTGGG (3)
4.50.0045
HypothalamusTGCAGGTGCA (2)
1.80.0018
E12.5 retinaACTGATTTTC (4)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
GATTATAACA (2)
TGCAGGTGCA (2)
52.60.0526
E14.5 retinaCAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
GCATTCCAGC (2)
40.10.0401
E16.5 retinaCAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
39.80.0398
E18.5 retinaCAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
30.90.0309
P0.5 retinaACTGATTTTC (4)
AGCAAATCAA (2)
CAGGTTTGGG (3)
TGCAGGTGCA (2)
37.30.0373
P2.5 retinaAGCAAATCAA (2)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
28.20.0282
P4.5 retinaACTGATTTTC (4)
CAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
29.80.0298
P6.5 retinaCAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
GATTATAACA (2)
TGCAGGTGCA (2)
16.70.0167
P10.5 crx- retinaACTGATTTTC (4)
CAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
5.70.0057
P10.5 crx+ retinaCAGGTTTGGG (3)
CCTCAAAAAA (2)
CTTGCTCTGT (2)
250.025
Adult retinalCAGGTTTGGG (3)
CTTGCTCTGT (2)
TGCAGGTGCA (2)
7.50.0075
ONLAGCAAATCAA (2)
CCTCAAAAAA (2)
TGCAGGTGCA (2)
5.70.0057