Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.26908 AI314760expressed sequence AI314760 18    106885 
 Mm.26908 Csnk1a1casein kinase 1, alpha 1 18  18 D3  93687 
 Gene Ontology ATP binding | cellular_component unknown | protein amino acid phosphorylation | protein kinase activity | protein serine/threonine kinase activity | transferase activity | Wnt receptor signaling pathway
 Human Homolog CSNK1A1[casein kinase 1, alpha 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 104 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GGAGAGACAA (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
31.10.0311
Cb medulloblastomaATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
GAATCTTTAG (3)
GAGTTAATTA (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TGGTTGTGAA (2)
27.60.0276
P8 GC+1d cultureCCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAGTTAATTA (2)
GGAGAGACAA (2)
GTGGCTCATT (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TCAAGATAAA (2)
TGGTTGTGAA (2)
TTTGGTAAGA (2)
31.90.0319
P8 GC+SHH+1d cultureATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAGTTAATTA (2)
GGAGAGACAA (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TGGTTGTGAA (2)
36.40.0364
3T3 fibroblastsATTTATCACA (2)
CTTGTCAGTT (2)
GGAGAGACAA (2)
TATGTGTGTT (2)
24.50.0245
E15 cortexCTTGTCAGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
14.80.0148
P1 cortexCCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAATCTTTAG (3)
GGAGAGACAA (2)
GTGGCTCATT (2)
22.50.0225
HypothalamusATTTATCACA (2)
CTTGTCAGTT (2)
GAGTTAATTA (2)
TATGTGTGTT (2)
TTTGGTAAGA (2)
180.018
E12.5 retinaATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GTGGCTCATT (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
24.50.0245
E14.5 retinaCTTGTCAGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TCAAGATAAA (2)
TTTGGTAAGA (2)
14.60.0146
E16.5 retinaATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
TATGTGTGTT (2)
19.90.0199
E18.5 retinaCCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
19.90.0199
P0.5 retinaATTTATCACA (2)
CTTGTCAGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
19.60.0196
P2.5 retinaGAATCTTTAG (3)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TTTGGTAAGA (2)
14.20.0142
P4.5 retinaATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
120.012
P6.5 retinaATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
TATGTGTGTT (2)
TCAAGATAAA (2)
TGGTTGTGAA (2)
TTTGGTAAGA (2)
18.50.0185
P10.5 crx- retinaCCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAATCTTTAG (3)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TCAAGATAAA (2)
33.50.0335
P10.5 crx+ retinaCCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GAGTTAATTA (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
TGGTTGTGAA (2)
24.90.0249
Adult retinalATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
18.60.0186
ONLATTTATCACA (2)
CCGTTCTTCT (4)
CTTGTCAGTT (2)
GTGGCTCATT (2)
GTGTCCGGTT (2)
TATGTGTGTT (2)
210.021