Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.270278 Tefthyrotroph embryonic factor 15  15 46.7 cM  21685 
 Gene Ontology DNA binding | double-stranded DNA binding | nucleus | positive regulation of transcription from Pol II promoter | protein binding | regulation of transcription, DNA-dependent | rhythmic behavior | transcriptional activator activity
 Human Homolog TEF[thyrotrophic embryonic factor]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 104 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCACTTAAAAA (2)
CACTTAGAAC
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTG (2)
40.70.0407
Cb medulloblastomaATCAAAAAAA (2)
CACTTAAAAA (2)
GATCAAAAAA
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTG (2)
48.50.0485
P8 GC+1d cultureATCAAAAAAA (2)
CACTTAAAAA (2)
GATCAAAAAA
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
42.20.0422
P8 GC+SHH+1d cultureATCAAAAAAA (2)
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTG (2)
38.60.0386
3T3 fibroblastsTGTGTGTGTG (2)
280.028
E15 cortexCACTTAGAAC
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
19.70.0197
P1 cortexATCAAAAAAA (2)
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTG (2)
36.30.0363
HypothalamusATCAAAAAAA (2)
CACTTAGAAA
GATCAAAAAA
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
39.80.0398
E12.5 retinaATCAAAAAAA (2)
CACTTAGAAC
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTG (2)
58.30.0583
E14.5 retinaATCAAAAAAA (2)
GGTGTTAATG (3)
TGTGTGTGTG (2)
58.30.0583
E16.5 retinaATCAAAAAAA (2)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
50.60.0506
E18.5 retinaATCAAAAAAA (2)
CACTTAAAAA (2)
CACTTAGAAC
GATCAAAAAA
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTG (2)
61.80.0618
P0.5 retinaATCAAAAAAA (2)
CACTTAAAAA (2)
CACTTAGAAC
GAAATGCCTG
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
49.20.0492
P2.5 retinaATCAAAAAAA (2)
CACTTAGAAC
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTG (2)
47.50.0475
P4.5 retinaATCAAAAAAA (2)
CACTTAGAAC
GAAATGCCTG
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
61.50.0615
P6.5 retinaATCAAAAAAA (2)
CACTTAGAAA
CACTTAGAAC
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
63.50.0635
P10.5 crx- retinaATCAAAAAAA (2)
CACTTAGAAA
CACTTAGAAC
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
76.30.0763
P10.5 crx+ retinaATCAAAAAAA (2)
CACTTAGAAC
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTG (2)
69.20.0692
Adult retinalATCAAAAAAA (2)
CACTTAGAAA
CACTTAGAAC
GATCAAAAAA
TCAGTGTCTG (2)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
87.20.0872
ONLCACTTAGAAC
GGTGTTAATG (3)
TGAGCCAACT (2)
TGTGTGTGTA (2)
TGTGTGTGTG (2)
34.40.0344