Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.270999	C430014D17Rik	RIKEN cDNA C430014D17 gene	3		229542
Mm.270999	AL118180	expressed sequence AL118180	5		404569
Mm.270999	4930537H20Rik	RIKEN cDNA 4930537H20 gene	3		75825
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 79 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) AATGAGTCCT (3) CCCTGCCCTG (4) GAAAGCAAAA (4) TACAATCTGA 213.6 0.2136 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) TACAATCTGA TAGTAAAACC (3) 807 0.807 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) TAGTAAAACC (3) TTGTGACCAG (3) 212.2 0.2122 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) GTAAAGTATT (3) TATATAAGCT (4) TTGTGACCAG (3) 286.9 0.2869 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) CAGTGCCTGT (4) CCCTGCCCTG (4) TTGTGACCAG (3) 52.5 0.0525 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) 217.7 0.2177 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) 245.4 0.2454 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) CAGTGCCTGT (4) CCCTGCCCTG (4) TATATAAGCT (4) 130.4 0.1304 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAGTGCCTGT (4) CCCTGCCCTG (4) CTGGTCTTGA TACAATCTGA 148.4 0.1484 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAGTGCCTGT (4) CCCTGCCCTG (4) 100.1 0.1001 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) AATGAGTCCT (3) CTGGTCTTGA 47.1 0.0471 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) GTAAAGTATT (3) TTGTGACCAG (3) 381.9 0.3819 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) CAGTGCCTGT (4) CCCTGCCCTG (4) GAAAGCAAAA (4) TGGGTTCTAG (3) 129.7 0.1297 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) GTAAAGTATT (3) 336.1 0.3361 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) CTGGTCTTGA GAAAGCAAAA (4) TATATAAGCT (4) 293.3 0.2933 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) GAAAGCAAAA (4) TAGTAAAACC (3) TATATAAGCT (4) TGGGTTCTAG (3) TTGTGACCAG (3) 291.9 0.2919 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) CAGTGCCTGT (4) CCCTGCCCTG (4) 57.6 0.0576 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) AATGAGTCCT (3) CCCTGCCCTG (4) CTGGTCTTGA TTGTGACCAG (3) 117.2 0.1172 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) TGGGTTCTAG (3) TTGTGACCAG (3) 70.5 0.0705 ONL AAAAAAAAAA (2) CCCTGCCCTG (4) TACAATCTGA 111 0.111