Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.271567 F830003O12RikRIKEN cDNA F830003O12 gene 15    403350 
 Mm.271567 6030446N20RikRIKEN cDNA 6030446N20 gene 18    338363 
 Human Homolog MGC11386[hypothetical protein MGC11386]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 41 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGCCTCTGCAT (29)8.20.0082
P8 Cb GCCTTATTTTTA (6)1.60.0016
Cb medulloblastomaGCCTCTGCAT (29)6.90.0069
Cb medulloblastomaCTTATTTTTA (6)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGCCTCTGCAT (29)20.50.0205
P8 GC+1d cultureCCCTCCCACA (5)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGCCTCTGCAT (29)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureGCAGCTGCTG (6)1.20.0012
3T3 fibroblastsGCCTCTGCAT (29)70.007
3T3 fibroblastsAGAGGAAGCA (5)3.50.0035
E15 cortexGCCTCTGCAT (29)39.60.0396
P1 cortexGCCTCTGCAT (29)18.20.0182
HypothalamusGCCTCTGCAT (29)10.90.0109
HypothalamusCTTATTTTTA (6)7.20.0072
HypothalamusCTCTGCAAAA (2)1.80.0018
HypothalamusTGGTATACAA (3)1.80.0018
E12.5 retinaGCCTCTGCAT (29)11.30.0113
E12.5 retinaTGGTATACAA (3)1.90.0019
E14.5 retinaGCCTCTGCAT (29)14.60.0146
E16.5 retinaGCCTCTGCAT (29)16.30.0163
E16.5 retinaCTCTGCAAAA (2)1.80.0018
E18.5 retinaGCCTCTGCAT (29)9.10.0091
E18.5 retinaCTCTGCAAAA (2)1.80.0018
P0.5 retinaGCCTCTGCAT (29)23.60.0236
P2.5 retinaGCCTCTGCAT (29)31.70.0317
P2.5 retinaCTTATTTTTA (6)1.80.0018
P4.5 retinaGCCTCTGCAT (29)19.80.0198
P4.5 retinaAGAGGAAGCA (5)20.002
P4.5 retinaTGGTATACAA (3)20.002
P6.5 retinaGCCTCTGCAT (29)21.70.0217
P6.5 retinaCCCTCCCACA (5)1.70.0017
P10.5 crx- retinaGCCTCTGCAT (29)27.90.0279
P10.5 crx- retinaCTCTGCAAAA (2)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGCAGCTGCTG (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCCTCTGCAT (29)32.70.0327
P10.5 crx+ retinaCTTATTTTTA (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCAGCTGCTG (6)1.90.0019
Adult retinalGCCTCTGCAT (29)33.30.0333
Adult retinalGCAGCTGCTG (6)1.90.0019
Adult retinalTGGTATACAA (3)1.90.0019
ONLGCCTCTGCAT (29)17.20.0172