Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.274690 D930017J03RikRIKEN cDNA D930017J03 gene 14    320391 
 Mm.274690 Hnrpcheterogeneous nuclear ribonucleoprotein C 14  14 20.0 cM  15381 
 Gene Ontology nucleus | pronucleus | ribonucleoprotein complex | RNA binding | RNA splicing | viral nucleocapsid
 Human Homolog HNRPC[heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C (C1/C2)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 122 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATTCCCGTG (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TTGCTGCGGC (2)
52.30.0523
Cb medulloblastomaATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
TTGCTGCGGC (2)
34.60.0346
P8 GC+1d cultureAAAGCATAGA (2)
AATTAATGAA (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TTGCTGCGGC (2)
47.80.0478
P8 GC+SHH+1d cultureAATTCCCGTG (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
59.80.0598
3T3 fibroblastsATTGCCCTGC (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
490.049
E15 cortexATTGCCCTGC (2)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
34.60.0346
P1 cortexCATACCAATA (2)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
180.018
HypothalamusATTGCCCTGC (2)
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
TTGCTGCGGC (2)
25.30.0253
E12.5 retinaAATTCCCGTG (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TTGCTGCGGC (2)
48.90.0489
E14.5 retinaATTGCCCTGC (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
34.50.0345
E16.5 retinaATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
16.20.0162
E18.5 retinaAAAGCATAGA (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
63.70.0637
P0.5 retinaAATTCCCGTG (2)
ATTGCCCTGC (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
39.40.0394
P2.5 retinaAAAGCATAGA (2)
ATTGCCCTGC (2)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TTGCTGCGGC (2)
28.30.0283
P4.5 retinaAATTCCCGTG (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
39.60.0396
P6.5 retinaAATTAATGAA (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
GGATTTGGCC (3)
GGTTATTTTT (2)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
TTGCTGCGGC (2)
55.20.0552
P10.5 crx- retinaAAAGCATAGA (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
CATACCAATA (2)
GGATTTGGCC (3)
TCATATCTGT (3)
TGAAGTACTC (3)
35.40.0354
P10.5 crx+ retinaAATTCCCGTG (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
TTGCTGCGGC (2)
49.90.0499
Adult retinalAATTAATGAA (2)
ATAAAACTGA (4)
ATTGCCCTGC (2)
GGTTATTTTT (2)
TGAAGTACTC (3)
TTGCTGCGGC (2)
26.10.0261
ONLAATTAATGAA (2)
ATTGCCCTGC (2)
GGATTTGGCC (3)
TGAAGTACTC (3)
40.10.0401