Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.275039	Xpo5	exportin 5	17		72322
Gene Ontology	protein transporter activity | protein-nucleus export | tRNA binding
Human Homolog	XPO5[exportin 5]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 102 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGAAACTCAA (2) AGAAATTCAA CCTTTAATCT (2) GAAGCTCTGG (2) GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 40.7 0.0407 Cb medulloblastoma GCTGCTGTGT (3) GCTTGCTGTG (4) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 117.8 0.1178 P8 GC+1d culture AAGCAGAGGA (3) AGAAACTCAA (2) CCTTTAATCT (2) GAAGCTCTGG (2) GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 31.8 0.0318 P8 GC+SHH+1d culture AGAAACTCAA (2) CCTTTAATCT (2) GCTGCTGTGT (3) GCTTCCCTGG (2) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 69 0.069 3T3 fibroblasts AGAAACTCAA (2) CCTTTAATCT (2) GAGCCTGATC GCTTCCCTGG (2) GCTTGCTGTG (4) TCAAAAAAAA (2) 31.5 0.0315 E15 cortex GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) 19.7 0.0197 P1 cortex CCTTTAATCT (2) GAAGCTCTGG (2) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 36.2 0.0362 Hypothalamus AGAAATTCAA CCTTTAATCT (2) GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) 45.2 0.0452 E12.5 retina AGAAACTCAA (2) CCTTTAATCT (2) GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 37.7 0.0377 E14.5 retina CCTTTAATCT (2) GAGCCTGATC GCTGCTGTGT (3) GTGGCTTGAA TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 72.8 0.0728 E16.5 retina GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 32.5 0.0325 E18.5 retina GCTGCTGTGT (3) GTGGCTTGAA TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 63.7 0.0637 P0.5 retina AAGCAGAGGA (3) AGAAACTCAA (2) CCTTTAATCT (2) GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) 43.2 0.0432 P2.5 retina AAGCAGAGGA (3) AGAAACTCAA (2) CCTTTAATCT (2) GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 58.2 0.0582 P4.5 retina CCTTTAATCT (2) GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 57.4 0.0574 P6.5 retina AGAAACTCAA (2) CCTTTAATCT (2) GCTGCTGTGT (3) GCTTGCTGTG (4) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 55.1 0.0551 P10.5 crx- retina GAGCCTGATC GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 26.1 0.0261 P10.5 crx+ retina AAGCAGAGGA (3) AGAAACTCAA (2) GCTGCTGTGT (3) GCTTCCCTGG (2) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 34.5 0.0345 Adult retinal AAGCAGAGGA (3) AGAAACTCAA (2) AGAAATTCAA CCTTTAATCT (2) GCTGCTGTGT (3) TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 48.3 0.0483 ONL AAGCAGAGGA (3) AGAAACTCAA (2) CCTTTAATCT (2) GTGGCTTGAA TCAAAAAAAA (2) TCAGTAAAAA 42.1 0.0421