Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.275728 6330549H03RikRIKEN cDNA 6330549H03 gene 12    108667 
 Mm.275728 AA675043expressed sequence AA675043 8    101972 
 Mm.275728 Gtf2a1general transcription factor II A, 1 12    83602 
 Gene Ontology nucleus | transcription initiation factor activity | transcription initiation from Pol II promoter
 Human Homolog GTF2A1[general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 38 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGATTTTAA (3)
TCTCCTTCCT (4)
TTTGACAATG (4)
4.80.0048
Cb medulloblastomaCAGATTTTAA (3)
TTTGACAATG (4)
16.20.0162
P8 GC+1d cultureCAGATTTTAA (3)
GAAGTGTGTG (3)
GAGCTGCAGT (3)
5.60.0056
P8 GC+SHH+1d cultureAAATGAAAAT (4)
CAGATTTTAA (3)
GAAGTGTGTG (3)
GAGCTGCAGT (3)
7.10.0071
P1 cortexAAATGAAAAT (4)
4.50.0045
HypothalamusCAGATTTTAA (3)
TTTCCTTAGA (4)
5.40.0054
E12.5 retinaCAGATTTTAA (3)
TTTGACAATG (4)
5.70.0057
E14.5 retinaCAGATTTTAA (3)
TCTCCTTCCT (4)
3.60.0036
E18.5 retinaCAGATTTTAA (3)
TTTCCTTAGA (4)
3.60.0036
P0.5 retinaAAATGAAAAT (4)
CAGATTTTAA (3)
5.90.0059
P2.5 retinaAAATGAAAAT (4)
CAGATTTTAA (3)
5.30.0053
P4.5 retinaGAGCTGCAGT (3)
20.002
P6.5 retinaAAATGAAAAT (4)
CAGATTTTAA (3)
GAGCTGCAGT (3)
TTTCCTTAGA (4)
8.40.0084
P10.5 crx- retinaGAGCTGCAGT (3)
1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCAGATTTTAA (3)
GAAGTGTGTG (3)
5.70.0057
Adult retinalCAGATTTTAA (3)
TTTCCTTAGA (4)
3.80.0038
ONLAAATGAAAAT (4)
CAGATTTTAA (3)
GAAGTGTGTG (3)
5.70.0057