Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.276030	2600009P04Rik	RIKEN cDNA 2600009P04 gene	9		66572
Mm.276030	Elavl3	ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 3 (Hu antigen C)	9	9 5.0 cM	15571
Gene Ontology	cell differentiation | neurogenesis | RNA binding
Human Homolog	ELAVL3[ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 3 (Hu antigen C)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 93 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAGAGGGGA (2) ACAGTCTATG (2) AGTTTGCAGG (2) ATTCCCCCAC (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) GGATGGCTTA (3) GTGATGGCTT (2) 48.9 0.0489 Cb medulloblastoma ACAGTCTATG (2) CCAGAAAATA (2) GGATGGCTTA (3) GTGATGGCTT (2) 41.6 0.0416 P8 GC+1d culture AAAGAGGGGA (2) ACAGTCTATG (2) AGTTTGCAGG (2) ATTCCCCCAC (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) GCTATCGCCA (2) GTGATGGCTT (2) TGCGGAGGGC (2) TTTGAAACTT (2) 76.3 0.0763 P8 GC+SHH+1d culture ACAGTCTATG (2) AGTTTGCAGG (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) GGATGGCTTA (3) GTGATGGCTT (2) TGATGTGTGA (4) 44.6 0.0446 E15 cortex AAAGAGGGGA (2) AGTTTGCAGG (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) GCTATCGCCA (2) GGATGGCTTA (3) 69.1 0.0691 P1 cortex ACAGTCTATG (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) 77.3 0.0773 Hypothalamus ACAGTCTATG (2) CACTTGGACC (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) GTGATGGCTT (2) 12.6 0.0126 E12.5 retina ACAGTCTATG (2) AGTTTGCAGG (2) CCAGAAAATA (2) GGATGGCTTA (3) TGCGGAGGGC (2) 20.7 0.0207 E14.5 retina ACAGTCTATG (2) CACTTGGACC (2) CCAGAAAATA (2) GGATGGCTTA (3) TGATGTGTGA (4) TTTGAAACTT (2) 30.9 0.0309 E16.5 retina AAAGAGGGGA (2) ACAGTCTATG (2) ATTCCCCCAC (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) GTGATGGCTT (2) 48.9 0.0489 E18.5 retina AAAGAGGGGA (2) ACAGTCTATG (2) CCAGAAAATA (2) GTGATGGCTT (2) TTTGAAACTT (2) 27.2 0.0272 P0.5 retina CACTTGGACC (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) 9.9 0.0099 P2.5 retina AAAGAGGGGA (2) CCAGAAAATA (2) TTTGAAACTT (2) 17.6 0.0176 P4.5 retina ACAGTCTATG (2) CCAGAAAATA (2) GGATGGCTTA (3) 13.9 0.0139 P6.5 retina ACAGTCTATG (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) 16.7 0.0167 P10.5 crx- retina ACAGTCTATG (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) TGATGTGTGA (4) TGCGGAGGGC (2) 31.6 0.0316 P10.5 crx+ retina AAAGAGGGGA (2) ACAGTCTATG (2) ATTCCCCCAC (2) CCAGAAAATA (2) GCTATCGCCA (2) 30.7 0.0307 Adult retinal ACAGTCTATG (2) CCAGAAAATA (2) CCCCACACAC (2) GTGATGGCTT (2) TGCGGAGGGC (2) 16.8 0.0168 ONL CCAGAAAATA (2) 1.9 0.0019